FANCM基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
FANCM基因编码一种DNA修复蛋白,参与范可尼贫血通路和同源重组修复,其突变与多种癌症风险相关。
基因信息卡
| 基因符号 | FANCM |
|---|---|
| 基因全名 | FA complementation group M |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 14q21.2 |
| NCBI Gene ID | 57697 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57697 |
| Ensembl ID | ENSG00000187790 |
| UniProt ID | Q8IYD8 |
| OMIM ID | 609644 |
| HGNC ID | 23168 |
| 基因别名 | KIAA1596, C20orf17, FAAP250 |
基因功能与研究简介
FANCM基因编码一种DNA修复蛋白,属于范可尼贫血(FA)核心复合物的组成部分。该蛋白具有ATP酶和核酸酶活性,参与DNA链间交联(ICL)修复、同源重组(HR)和复制叉稳定。FANCM通过识别和结合DNA损伤位点,招募下游修复因子,维持基因组稳定性。其功能缺陷与范可尼贫血、乳腺癌和卵巢癌等疾病风险增加相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 范可尼贫血 | FANCM双等位基因突变导致FA互补群M,表现为骨髓衰竭、发育异常和癌症易感性。 | 已明确致病 |
| 乳腺癌 | FANCM截短突变(如c.5791C>T, p.Arg1931Ter)与乳腺癌风险增加相关,尤其在家族性病例中。 | 较强研究证据 |
| 卵巢癌 | FANCM突变可能增加卵巢癌风险,但证据尚不充分。 | 潜在关联 |
| 前列腺癌 | FANCM突变与前列腺癌风险关联存在争议,部分研究显示风险增加。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 卵巢 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| U2OS | 暂无可靠数据 | 骨肉瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.5791C>T (p.Arg1931Ter) | 截短突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.5101C>T (p.Gln1701Ter) | 截短突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1972C>T (p.Arg658Ter) | 截短突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1447C>T (p.Gln483Ter) | 截短突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
FANCM截短突变导致蛋白功能丧失,影响DNA修复,增加基因组不稳定性和癌症风险。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明FANCM存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明FANCM突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • DNA binding (GO:0003677) | • ATP binding (GO:0005524) |
| • DNA helicase activity (GO:0003678) | • Fanconi anemia nuclear complex (GO:0031389) |
| • DNA repair (GO:0006281) | • interstrand cross-link repair (GO:0036297) |
| • homologous recombination (GO:0000724) |
相关通路
• Fanconi anemia pathway (WP2063)
• Homologous recombination repair (WP2063)
蛋白质功能简介
FANCM蛋白由2048个氨基酸组成,包含DEAH/DEAH box helicase结构域和核酸酶结构域。它作为FA核心复合物的支架蛋白,识别DNA损伤并激活FA通路。FANCM还参与复制叉稳定和同源重组修复,其功能异常导致DNA损伤积累和细胞凋亡。
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