SBF1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SBF1基因编码肌管素相关蛋白家族成员,参与膜运输和细胞信号传导,其突变与Charcot-Marie-Tooth病4B3型相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SBF1 |
|---|---|
| 基因全名 | SET binding factor 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 22q13.33 |
| NCBI Gene ID | 6464 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6464 |
| Ensembl ID | ENSG00000000219 |
| UniProt ID | O95248 |
| OMIM ID | 603560 |
| HGNC ID | 10542 |
| 基因别名 | MTMR5, CMT4B3 |
基因功能与研究简介
SBF1基因编码SET结合因子1,属于肌管素相关蛋白家族,包含一个PH结构域和一个Rac诱导的招募结构域。该蛋白在细胞膜运输和信号转导中发挥作用,可能参与调控内体-溶酶体途径。SBF1突变与Charcot-Marie-Tooth病4B3型(CMT4B3)相关,该病为常染色体隐性遗传的周围神经病变。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Charcot-Marie-Tooth病4B3型 | SBF1基因突变导致蛋白功能异常,影响周围神经髓鞘形成和维持,导致进行性肌无力和感觉丧失。 | 已明确致病 |
| 周围神经病变 | SBF1突变可能与其他周围神经病变相关,但证据有限。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 周围神经 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1750C>T (p.Arg584Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.2080C>T (p.Arg694Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.2395C>T (p.Arg799Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
SBF1突变导致蛋白功能丧失,影响其正常生理作用,是CMT4B3的主要致病机制。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明SBF1突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明SBF1突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005543 phospholipid binding |
| • GO:0005768 endosome | • GO:0005769 early endosome |
| • GO:0005770 late endosome | • GO:0005886 plasma membrane |
| • GO:0016020 membrane | • GO:0031410 cytoplasmic vesicle |
| • GO:0046872 metal ion binding | • GO:0050839 metal ion binding |
相关通路
• Endocytosis
• Vesicle-mediated transport
蛋白质功能简介
SBF1蛋白包含一个PH结构域,能够结合磷脂酰肌醇,参与膜运输。它可能作为衔接蛋白,调节内体运输和信号转导。SBF1在神经系统中表达,对周围神经的髓鞘形成和维持至关重要。