ACSL4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ACSL4编码长链脂酰辅酶A合成酶4,在脂质代谢、铁死亡调控及多种疾病中发挥关键作用。
基因信息卡
| 基因符号 | ACSL4 |
|---|---|
| 基因全名 | acyl-CoA synthetase long chain family member 4 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | Xq23 |
| NCBI Gene ID | 2182 ncbi.nlm.nih.gov/gene/2182 |
| Ensembl ID | ENSG00000068366 |
| UniProt ID | O60488 |
| OMIM ID | 300157 |
| HGNC ID | 3571 |
| 基因别名 | ACS4, FACL4, LACS4 |
基因功能与研究简介
ACSL4基因编码长链脂酰辅酶A合成酶4,属于长链脂酰辅酶A合成酶家族。该酶催化长链脂肪酸(C16-C20)与辅酶A结合,形成脂酰辅酶A,参与脂质合成、β-氧化和信号转导等过程。ACSL4在多种组织中表达,尤其在脑、肾上腺和脂肪组织中高表达。研究表明,ACSL4是铁死亡(ferroptosis)的关键调控因子,通过促进含多不饱和脂肪酸的磷脂合成,增加细胞对铁死亡的敏感性。此外,ACSL4与多种疾病相关,包括癌症、神经系统疾病和代谢性疾病。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | ACSL4在肝细胞癌中表达上调,可能通过促进脂质合成和铁死亡抵抗,促进肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | ACSL4在乳腺癌中表达异常,与肿瘤侵袭性和不良预后相关。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | ACSL4在结直肠癌中表达上调,可能通过调控脂质代谢影响肿瘤生长。 | 潜在关联 |
| 阿尔茨海默病 | ACSL4在脑组织中高表达,可能参与脂质代谢紊乱和神经炎症,与阿尔茨海默病相关。 | 潜在关联 |
| 精神分裂症 | ACSL4基因变异与精神分裂症风险相关,可能通过影响脂质代谢和神经发育。 | 潜在关联 |
| 铁死亡相关疾病 | ACSL4是铁死亡的关键调控因子,其表达水平影响细胞对铁死亡的敏感性,与缺血再灌注损伤、神经退行性疾病等相关。 | 较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肾上腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脂肪组织 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HT-29 | 暂无可靠数据 | 结直肠腺癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.664G>A (p.Val222Met) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,与精神分裂症相关 |
| c.1150C>T (p.Arg384Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响酶活性,与疾病关联待研究 |
| c.1573C>T (p.Arg525Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性,与疾病关联待研究 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变:导致ACSL4酶活性降低或丧失,可能影响脂质代谢和铁死亡调控。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变:增强ACSL4酶活性或表达,可能促进脂质合成和铁死亡敏感性。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变:突变蛋白干扰野生型蛋白功能,导致整体功能下降。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004467 (long-chain fatty acid-CoA ligase activity) | • GO:0006631 (fatty acid metabolic process) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane) |
| • GO:0016020 (membrane) | • GO:0044594 (ferroptotic cell death) |
相关通路
• hsa00071 (Fatty acid degradation)
• hsa00561 (Glycerolipid metabolism)
• hsa01212 (Fatty acid metabolism)
• hsa04217 (Necroptosis)
• hsa04932 (Non-alcoholic fatty liver disease)
蛋白质功能简介
ACSL4蛋白由711个氨基酸组成,分子量约79 kDa。该蛋白定位于线粒体、过氧化物酶体和内质网,催化长链脂肪酸(C16-C20)与辅酶A结合,形成脂酰辅酶A。ACSL4对花生四烯酸(C20:4)和肾上腺素酸(C22:4)具有高亲和力,这些多不饱和脂肪酸是合成磷脂酰乙醇胺(PE)的重要底物。ACSL4通过促进含多不饱和脂肪酸的磷脂合成,增加细胞对铁死亡的敏感性。在铁死亡过程中,ACSL4表达上调,导致脂质过氧化积累,最终引发细胞死亡。此外,ACSL4还参与脂质信号转导、炎症反应和能量代谢。