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冷冻电镜结构解析

冷冻电镜(cryo-electron microscopy,cryo-EM)可在玻璃态冰中对生物大分子及其复合物进行成像,并通过计算重构获得三维密度图。在样品质量和数据条件合适的情况下,单颗粒分析可进一步支持原子模型构建,帮助研究者解析蛋白构象、复合物组装方式及配体结合模式。
艾迪基因可提供涵盖样品可行性评估、冷冻制样、数据采集、三维重构、模型构建与结构 解读的项目服务;如项目需要,还可衔接重组蛋白制备、细胞功能验证及结构导向药物设计,形成结构与功能相互验证的研究路径。

服务内容与交付标准

样品评估
评估纯度、均一性、聚集状态及颗粒分布,辅助判断后续冷冻制样可行性
交付标准:样品评估结果、项目建议
冷冻制样与条件优化
优化样品浓度、载网类型、冰层厚度及制样参数。
交付标准:筛网图像、制样条件记录
单颗粒冷冻电镜(SPA)
数据采集、运动校正、CTF 估计、颗粒挑选、二维分类、三维重构与多构象分析
交付标准:筛选后数据、三维密度图及数据处理报告
原子模型构建与验证
基于密度图开展模型搭建、精修、结构质量评估及图件制作
交付标准:原子坐标模型、模型验证结果、结构示意图
冷冻电镜断层成像(Cryo-ET,可选)
对细胞、细胞器或大分子复合物进行倾转序列采集与断层重构,观察近天然状态下的三维空间组织
交付标准:断层重构结果及分析报告
结构解读与延伸分析(可选)
开展界面、突变位点、构象变化和配体结合模式分析,并可衔接 SBDD、MD/FEP 或细胞功能验证。
交付标准:结构分析报告及约定的计算 / 验证结果
注:具体服务范围和交付物将根据样品类型、研究目标及项目合同确定;“原子模型”并非所有项目均可获得。

适用样品与研究场景

适用对象 典型研究需求
可溶性蛋白及复合物 解析蛋白构象、亚基组装、蛋白–蛋白相互作用界面
膜蛋白及复合物 研究 GPCR、离子通道、转运体等的构象与配体结合模式
抗原–抗体复合物 分析表位、结合界面及抗体作用机制
病毒、VLP 及大分子组装体 研究颗粒形貌、组装方式及结构特征
细胞与细胞器样品 通过 Cryo-ET 观察近天然状态下的三维结构与空间组织

服务优势

样品质量前置评估
先评估、再上机,尽早识别聚集、降解、构象不均一等风险,减少无效数据采集。
全流程技术衔接
从蛋白制备、结构解析到功能验证可按需组合,减少跨供应商沟通与样品反复转运。
技术路线灵活
可根据样品和研究目标选择SPA、Cryo-ET、模型构建或计算分析等模块。
结果与质控可追溯
项目节点、关键参数、数据处理流程和交付清单按约定记录,便于论文、专利及后续研究使用。

服务流程

合作方式

合作方式 适合场景
单项服务 已有合格蛋白样品,仅需冷冻制样、数据采集、三维重构或模型构建等单项支持。
一站式项目 希望从蛋白制备开始,并将结构解析与细胞功能验证、SBDD 等后续研究衔接。

平台能力

平台 能力范围
蛋白制备与生化平台 重组蛋白表达、纯化与工艺优化;蛋白纯度、均一性、稳定性、活性及分子互作检测。
冷冻电镜平台 冷冻制样、单颗粒数据采集与处理、Cryo-ET、三维重构及模型构建。
计算化学平台 虚拟筛选、分子动力学模拟、自由能计算及结构导向的候选分子设计。

一、生化平台 Biochemical Platform

具备重组蛋白中试纯化工艺开发能力,配套完整蛋白活性、分子互作检测体系,提前优化膜蛋白稳定性,样品通过率较纯电镜服务商大幅提升。

核心能力构建:

重组蛋白的高效表达、纯化与规模化制备工艺开发

蛋白功能活性检测、结合力分析及生物学机制验证

二、冷冻电镜平台 Electron Microscopy Platform

高端冷冻电镜中心全套硬件,无需客户投入千万级设备采购成本:

制样设备:Vitrobot Mark IV、Leica EM GP,精准控温控湿,保障蛋白冷冻样品均匀无聚集;

成像设备:300keV Titan Krios(原子级高分辨解析)+ 200kV Talos(样品快速预筛),每周稳定开机 48h 以上,机时充足无需长期排队,7 天加急通道可出高分辨结构;

算力集群:专业超算平台算力,PB 级存储,极速完成电镜三维重构、MD 分子动力学、FEP 自由能计算,缩短数据分析周期。

海量电镜数据快速重构、分子动力学 / 自由能 FEP 高速计算,缩短数据分析周期。

三、计算化学平台 Computational Chemistry Platform

一体化智能药物发现引擎,覆盖高通量虚拟筛选、分子动力学模拟、FEP 自由能精准评估、AI 全新小分子从头设计全链条。

应用方向

应用场景:神经退行 / 纳米材料

结构生物学在药物研发中的应用

病毒疫苗研发
解析刺突蛋白、病毒载体 VLP 结构,支撑抗体、疫苗分子设计
膜蛋白靶向药
GPCR / 离子通道无需结晶,冷冻电镜直接解析原子结合口袋,开发小分子、抗体药物
神经退行性疾病基础研究
解析 Tau 蛋白、淀粉样蛋白聚集体结构,阐明致病机制
纳米递送载体
LNP、外泌体形貌粒径表征,优化 mRNA 疫苗递送系统
临床前新药开发
直观观测药物 - 靶点结合模式,快速筛选优化先导化合物
纳米材料
如 mRNA 疫苗载体的脂质纳米粒结构分析

成功案例

案例 1|激酶 - 抑制剂复合物解析

分辨率 2.0 Å | 周期 7 天

价值:为肿瘤靶向小分子优化提供原子级结构基础

案例 2|酶抑制剂复合体结构

分辨率 2.6 Å | 周期 1 个月

价值:指导抑制剂亲和力改造

案例 3|GPCR - 抗体膜蛋白复合物

分辨率 3.1 Å | 周期 2 个月

价值:攻克膜蛋白结晶难题,支撑 GPCR 新药管线开发

案例 4|AI 虚拟筛选 + FEP 药物设计

价值:批量产出高潜力候选小分子,缩短筛选周期

合作保障体系

1三重保密保障

签署专属 NDA 保密协议,商业项目全部蛋白结构、分子模型知识产权 100% 归属委托方;

项目交付满 30 个工作日后,不可逆清除全部原始电镜成像数据集,无备份留存;

客户靶点、基因序列、实验数据分区域独立存储,严禁挪用于其他项目。

2样品失败兜底机制

项目启动前免费开展蛋白样品可行性评估,提前预判聚集、降解、构象不均一等风险;

若蛋白自身质量缺陷导致解析失败,仅收取预筛耗材成本,不收取全额解析费用;

我方设备故障、操作失误造成数据报废,免费复测一轮,无额外耗材、机时收费。

3交付内容和时效保障

交付物清单标准化展示(分工业 / 学术 / 海外客户):

基础交付:原始电镜图像、EMD 电子密度图、PDB 原子模型、专利 / 论文级结构图、完整中文实验报告;

增值可选:GLP 归档文件、全英文项目报告(海外客户专属);

时效:常规项目 12–20 工作日交付;加急 7 天极速出结构,适配期刊投稿、专利紧急申报。

4知识产权约定

工业药企付费项目:全部实验数据、三维结构、分子模型知识产权归客户独有;

学术合作课题:双方论文共同署名,文章投稿、数据公开发表前,必须取得双方书面确认。

Advantage and Characteristic

Optimazied Strategy
We have create a unique sgRNA Design Logic
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FAQ

Q1:冷冻电镜是否一定能获得原子级结构?
不能直接保证。最终分辨率受样品纯度、均一性、稳定性、分子量、柔性、构象异质性、制样质量和数据量等多因素影响。项目启动前建议先进行样品评估和预筛。
可以。建议同时提供蛋白序列、分子量、缓冲体系、浓度、纯度、保存条件、已知稳定性信息及研究目标,以便制定预筛和制样方案。
可以评估。此类样品通常需要重点优化去垢剂或脂质环境、复合物稳定性、构象均一性和样品浓度,具体以可行性评估结果为准。
可包括筛网图像、数据处理结果、三维密度图、原子坐标模型、验证结果、结构图件和项目报告;具体清单按项目范围和合同约定执行。
可根据论文发表需求协助整理密度图、模型及验证信息;数据库提交账号、公开时间和最终提交责任应在项目中提前约定。

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