APAF1基因|基因功能、疾病关联、突变与细胞凋亡研究

APAF1是凋亡体核心蛋白,调控线粒体凋亡通路,与肿瘤发生及神经退行性疾病相关。

基因信息卡

基因符号 APAF1
基因全名 apoptotic peptidase activating factor 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 12q23.1
NCBI Gene ID 317 ncbi.nlm.nih.gov/gene/317
Ensembl ID ENSG00000120868
UniProt ID O14727
OMIM ID 602233
HGNC ID 576
基因别名 CED4, APAF-1, FLJ98031

基因功能与研究简介

APAF1基因编码凋亡蛋白酶激活因子1,是细胞凋亡线粒体通路中的核心衔接蛋白。在细胞色素c和dATP存在下,APAF1寡聚化形成凋亡体,招募并激活caspase-9,进而启动caspase级联反应,导致细胞凋亡。APAF1在发育、免疫调节和肿瘤抑制中发挥重要作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症(多种类型) APAF1表达下调或功能缺失可导致凋亡逃逸,促进肿瘤发生和发展。 较强研究证据
神经退行性疾病(如阿尔茨海默病) APAF1介导的凋亡异常可能参与神经元丢失。 潜在关联
自身免疫性疾病 APAF1功能异常可能影响免疫细胞稳态。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脑 暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 中等表达
肝脏 暂无可靠数据 中等表达
肺 暂无可靠数据 中等表达
肾脏 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1339C>T (p.Arg447Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1699G>A (p.Glu567Lys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.2062C>T (p.Arg688Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变,导致APAF1蛋白截短或活性降低,削弱凋亡信号传导,可能促进肿瘤发生。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005509 calcium ion binding
• GO:0006915 apoptotic process • GO:0008637 apoptotic mitochondrial changes
• GO:0042981 regulation of apoptotic process • GO:0005739 mitochondrion
• GO:0005829 cytosol

相关通路

• Intrinsic Pathway for Apoptosis (Reactome: R-HSA-109606)
• Apoptosis (KEGG: hsa04210)
• p53 signaling pathway (KEGG: hsa04115)

蛋白质功能简介

APAF1蛋白包含CARD结构域、NACHT结构域和多个WD40重复序列。在正常条件下以单体形式存在,当细胞色素c释放到胞质时,APAF1结合细胞色素c和dATP,发生构象改变并寡聚化形成凋亡体。凋亡体招募pro-caspase-9,通过CARD-CARD相互作用使其自我剪切激活,进而激活下游caspase-3/7,执行细胞凋亡。

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