APAF1基因|基因功能、疾病关联、突变与细胞凋亡研究

APAF1是凋亡体核心蛋白,调控线粒体凋亡通路,与肿瘤发生及神经退行性疾病相关。

基因信息卡

基因符号 APAF1
基因全名 apoptotic peptidase activating factor 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 12q23.1
NCBI Gene ID 317 ncbi.nlm.nih.gov/gene/317
Ensembl ID ENSG00000120868
UniProt ID O14727
OMIM ID 602233
HGNC ID 576
基因别名 CED4, APAF-1, FLJ98031

基因功能与研究简介

APAF1基因编码凋亡蛋白酶激活因子1,是细胞凋亡线粒体通路中的核心衔接蛋白。在细胞色素c和dATP存在下,APAF1寡聚化形成凋亡体,招募并激活caspase-9,进而启动caspase级联反应,导致细胞凋亡。APAF1在发育、免疫调节和肿瘤抑制中发挥重要作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症(多种类型) APAF1表达下调或功能缺失可导致凋亡逃逸,促进肿瘤发生和发展。 较强研究证据
神经退行性疾病(如阿尔茨海默病) APAF1介导的凋亡异常可能参与神经元丢失。 潜在关联
自身免疫性疾病 APAF1功能异常可能影响免疫细胞稳态。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 中等表达
肝脏 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
肾脏 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1339C>T (p.Arg447Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1699G>A (p.Glu567Lys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.2062C>T (p.Arg688Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变,导致APAF1蛋白截短或活性降低,削弱凋亡信号传导,可能促进肿瘤发生。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005509 calcium ion binding
• GO:0006915 apoptotic process • GO:0008637 apoptotic mitochondrial changes
• GO:0042981 regulation of apoptotic process • GO:0005739 mitochondrion
• GO:0005829 cytosol

相关通路

Intrinsic Pathway for Apoptosis (Reactome: R-HSA-109606)
Apoptosis (KEGG: hsa04210)
p53 signaling pathway (KEGG: hsa04115)

蛋白质功能简介

APAF1蛋白包含CARD结构域、NACHT结构域和多个WD40重复序列。在正常条件下以单体形式存在,当细胞色素c释放到胞质时,APAF1结合细胞色素c和dATP,发生构象改变并寡聚化形成凋亡体。凋亡体招募pro-caspase-9,通过CARD-CARD相互作用使其自我剪切激活,进而激活下游caspase-3/7,执行细胞凋亡。

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