ATG5基因|自噬核心蛋白、疾病关联、突变与基因编辑研究

ATG5是自噬关键蛋白,参与细胞稳态调控,其突变与多种疾病相关,是重要的药物靶点。

基因信息卡

基因符号 ATG5
基因全名 autophagy related 5
基因类型 protein-coding
染色体位置 6q21
NCBI Gene ID 9474 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9474
Ensembl ID ENSG00000057608
UniProt ID Q9H1Y0
OMIM ID 604261
HGNC ID 589
基因别名 APG5, APG5L, ASP, hAPG5

基因功能与研究简介

ATG5(autophagy related 5)是自噬过程中的关键蛋白,参与自噬体膜的延伸和闭合。ATG5与ATG12结合形成ATG12-ATG5-ATG16L1复合物,促进LC3-I向LC3-II的转化,从而介导自噬体的形成。ATG5在细胞稳态、免疫应答、炎症调控和肿瘤抑制中发挥重要作用。ATG5的突变或表达异常与多种疾病相关,包括神经退行性疾病、感染性疾病和癌症。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
共济失调-毛细血管扩张症样综合征 ATG5突变导致自噬功能受损,影响神经细胞稳态,与共济失调-毛细血管扩张症样综合征相关。 ClinVar, OMIM
炎症性肠病 ATG5基因多态性影响自噬功能,与炎症性肠病(如克罗恩病)的易感性相关。 ClinVar, 文献
癌症 ATG5在多种癌症中表达异常,影响肿瘤细胞的自噬依赖性生存和凋亡,与肿瘤发生发展相关。 COSMIC, 文献

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脑 暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1336G>A (p.Glu446Lys) 错义突变 罕见 可能影响ATG5蛋白功能,与共济失调-毛细血管扩张症样综合征相关
c.130C>T (p.Arg44Ter) 无义突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失,与自噬缺陷相关
c.115G>A (p.Gly39Arg) 错义突变 罕见 可能影响ATG5功能,与炎症性肠病相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如无义突变或移码突变,导致ATG5蛋白功能缺失,自噬过程受阻。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前暂无明确证据表明ATG5存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变,可能通过干扰ATG12-ATG5-ATG16L1复合物的形成,抑制自噬功能。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0006914 (autophagy) • GO:0005776 (autophagosome membrane)
• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0005829 (cytosol)

相关通路

• hsa04140 (Autophagy - animal)
• hsa04136 (Autophagy - other)
• hsa04210 (Apoptosis)

蛋白质功能简介

ATG5蛋白由275个氨基酸组成,分子量约32 kDa。ATG5在自噬过程中作为关键蛋白,与ATG12结合形成ATG12-ATG5-ATG16L1复合物,该复合物具有E3样连接酶活性,促进LC3-I向LC3-II的转化,从而介导自噬体的形成。ATG5还参与凋亡调控、免疫应答和炎症反应。ATG5的异常表达或突变与多种疾病相关,包括神经退行性疾病、炎症性疾病和癌症。

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