ATG5基因|自噬核心蛋白、疾病关联、突变与基因编辑研究

ATG5是自噬关键蛋白,参与细胞稳态调控,其突变与多种疾病相关,是重要的药物靶点。

基因信息卡

基因符号 ATG5
基因全名 autophagy related 5
基因类型 protein-coding
染色体位置 6q21
NCBI Gene ID 9474 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9474
Ensembl ID ENSG00000057608
UniProt ID Q9H1Y0
OMIM ID 604261
HGNC ID 589
基因别名 APG5, APG5L, ASP, hAPG5

基因功能与研究简介

ATG5(autophagy related 5)是自噬过程中的关键蛋白,参与自噬体膜的延伸和闭合。ATG5与ATG12结合形成ATG12-ATG5-ATG16L1复合物,促进LC3-I向LC3-II的转化,从而介导自噬体的形成。ATG5在细胞稳态、免疫应答、炎症调控和肿瘤抑制中发挥重要作用。ATG5的突变或表达异常与多种疾病相关,包括神经退行性疾病、感染性疾病和癌症。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
共济失调-毛细血管扩张症样综合征 ATG5突变导致自噬功能受损,影响神经细胞稳态,与共济失调-毛细血管扩张症样综合征相关。 ClinVar, OMIM
炎症性肠病 ATG5基因多态性影响自噬功能,与炎症性肠病(如克罗恩病)的易感性相关。 ClinVar, 文献
癌症 ATG5在多种癌症中表达异常,影响肿瘤细胞的自噬依赖性生存和凋亡,与肿瘤发生发展相关。 COSMIC, 文献

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1336G>A (p.Glu446Lys) 错义突变 罕见 可能影响ATG5蛋白功能,与共济失调-毛细血管扩张症样综合征相关
c.130C>T (p.Arg44Ter) 无义突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失,与自噬缺陷相关
c.115G>A (p.Gly39Arg) 错义突变 罕见 可能影响ATG5功能,与炎症性肠病相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如无义突变或移码突变,导致ATG5蛋白功能缺失,自噬过程受阻。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前暂无明确证据表明ATG5存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变,可能通过干扰ATG12-ATG5-ATG16L1复合物的形成,抑制自噬功能。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0006914 (autophagy) • GO:0005776 (autophagosome membrane)
• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0005829 (cytosol)

相关通路

hsa04140 (Autophagy - animal)
hsa04136 (Autophagy - other)
hsa04210 (Apoptosis)

蛋白质功能简介

ATG5蛋白由275个氨基酸组成,分子量约32 kDa。ATG5在自噬过程中作为关键蛋白,与ATG12结合形成ATG12-ATG5-ATG16L1复合物,该复合物具有E3样连接酶活性,促进LC3-I向LC3-II的转化,从而介导自噬体的形成。ATG5还参与凋亡调控、免疫应答和炎症反应。ATG5的异常表达或突变与多种疾病相关,包括神经退行性疾病、炎症性疾病和癌症。

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