FERD3L基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

FERD3L(N-TWIST)是碱性螺旋-环-螺旋转录因子家族成员,在神经发育和肌肉生成中发挥关键作用,其异常表达与多种癌症相关。

基因信息卡

基因符号 FERD3L
基因全名 Fer3-like bHLH transcription factor
基因类型 protein-coding
染色体位置 7p21.3
NCBI Gene ID 64597 ncbi.nlm.nih.gov/gene/64597
Ensembl ID ENSG00000187957
UniProt ID Q96CJ1
OMIM ID 608598
HGNC ID 18517
基因别名 N-TWIST, bHLHa29, Class A basic helix-loop-helix protein 29

基因功能与研究简介

FERD3L(Fer3-like bHLH transcription factor)编码碱性螺旋-环-螺旋转录因子,属于bHLH家族。该蛋白在神经发育和肌肉生成中发挥关键作用,参与调控细胞分化和增殖。FERD3L的异常表达与多种癌症相关,如结直肠癌和乳腺癌,可能通过影响上皮-间质转化(EMT)促进肿瘤进展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
结直肠癌 FERD3L在结直肠癌中高表达,可能通过调控EMT相关基因促进肿瘤侵袭和转移。 较强研究证据
乳腺癌 FERD3L在乳腺癌中表达上调,与不良预后相关,可能参与肿瘤干细胞特性维持。 较强研究证据
神经发育异常 FERD3L在神经发育中起重要作用,但其突变与特定神经发育疾病的直接关联尚未明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
肌肉 暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123C>T (p.Arg41Trp) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.456delC (p.Pro152fs) 移码突变 暂无可靠数据 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变可能导致FERD3L蛋白活性降低或缺失,影响其转录调控功能,可能干扰正常发育过程。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变可能增强FERD3L的转录激活能力,促进细胞增殖或抑制分化,与肿瘤发生相关。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能产生干扰正常FERD3L功能的蛋白,影响其与DNA或辅因子结合,导致功能异常。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0001228 (DNA-binding transcription activator activity • RNA polymerase II-specific)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II)
• GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II)

相关通路

hsa04350 (TGF-beta signaling pathway)
hsa05200 (Pathways in cancer)

蛋白质功能简介

FERD3L蛋白属于bHLH转录因子家族,包含基本的DNA结合结构域和螺旋-环-螺旋结构域,能够识别E-box序列(CANNTG)并调控下游基因表达。在神经发育中,FERD3L参与神经元分化和轴突导向;在肌肉生成中,可能调控成肌细胞分化。此外,FERD3L在多种癌症中异常表达,通过调控EMT相关基因(如SNAI1、TWIST1)促进肿瘤侵袭和转移。

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