FERD3L基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

FERD3L(N-TWIST)是碱性螺旋-环-螺旋转录因子家族成员,在神经发育和肌肉生成中发挥关键作用,其异常表达与多种癌症相关。

基因信息卡

基因符号 FERD3L
基因全名 Fer3-like bHLH transcription factor
基因类型 protein-coding
染色体位置 7p21.3
NCBI Gene ID 64597 ncbi.nlm.nih.gov/gene/64597
Ensembl ID ENSG00000187957
UniProt ID Q96CJ1
OMIM ID 608598
HGNC ID 18517
基因别名 N-TWIST, bHLHa29, Class A basic helix-loop-helix protein 29

基因功能与研究简介

FERD3L(Fer3-like bHLH transcription factor)编码碱性螺旋-环-螺旋转录因子,属于bHLH家族。该蛋白在神经发育和肌肉生成中发挥关键作用,参与调控细胞分化和增殖。FERD3L的异常表达与多种癌症相关,如结直肠癌和乳腺癌,可能通过影响上皮-间质转化(EMT)促进肿瘤进展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
结直肠癌 FERD3L在结直肠癌中高表达,可能通过调控EMT相关基因促进肿瘤侵袭和转移。 较强研究证据
乳腺癌 FERD3L在乳腺癌中表达上调,与不良预后相关,可能参与肿瘤干细胞特性维持。 较强研究证据
神经发育异常 FERD3L在神经发育中起重要作用,但其突变与特定神经发育疾病的直接关联尚未明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脑 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肌肉 暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123C>T (p.Arg41Trp) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.456delC (p.Pro152fs) 移码突变 暂无可靠数据 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变可能导致FERD3L蛋白活性降低或缺失,影响其转录调控功能,可能干扰正常发育过程。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变可能增强FERD3L的转录激活能力,促进细胞增殖或抑制分化,与肿瘤发生相关。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能产生干扰正常FERD3L功能的蛋白,影响其与DNA或辅因子结合,导致功能异常。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0001228 (DNA-binding transcription activator activity • RNA polymerase II-specific)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II)
• GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II)

相关通路

• hsa04350 (TGF-beta signaling pathway)
• hsa05200 (Pathways in cancer)

蛋白质功能简介

FERD3L蛋白属于bHLH转录因子家族,包含基本的DNA结合结构域和螺旋-环-螺旋结构域,能够识别E-box序列(CANNTG)并调控下游基因表达。在神经发育中,FERD3L参与神经元分化和轴突导向;在肌肉生成中,可能调控成肌细胞分化。此外,FERD3L在多种癌症中异常表达,通过调控EMT相关基因(如SNAI1、TWIST1)促进肿瘤侵袭和转移。

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