LCE3E基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
LCE3E是表皮分化复合体中的晚期角质化包膜蛋白,参与皮肤屏障形成,与银屑病等皮肤疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | LCE3E |
|---|---|
| 基因全名 | Late Cornified Envelope 3E |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1q21.3 |
| NCBI Gene ID | 353138 ncbi.nlm.nih.gov/gene/353138 |
| Ensembl ID | ENSG00000215251 |
| UniProt ID | Q5T5A8 |
| OMIM ID | 612603 |
| HGNC ID | 29443 |
| 基因别名 | LEP3E, LCE3E |
基因功能与研究简介
LCE3E(Late Cornified Envelope 3E)是位于染色体1q21.3的表皮分化复合体(Epidermal Differentiation Complex, EDC)中的一员,编码晚期角质化包膜蛋白。该蛋白在表皮终末分化过程中表达,参与角质细胞包膜的形成,对皮肤屏障功能的维持至关重要。LCE3E基因的变异与银屑病等皮肤疾病的风险相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 银屑病 | LCE3E基因缺失或表达下调可能削弱皮肤屏障,增加银屑病易感性。 | 较强研究证据 |
| 寻常型银屑病 | LCE3E基因拷贝数变异与寻常型银屑病风险相关。 | 较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 皮肤 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 食管 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 其他组织 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 角质形成细胞 | 暂无可靠数据 | 分化时表达上调 |
| 其他细胞系 | 暂无可靠数据 | 暂无明确证据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| LCE3E缺失 | 拷贝数变异 | 人群中常见 | 功能缺失,可能增加银屑病风险 |
| rs4112788 | SNP | 常见 | 与LCE3C_LCE3B-del连锁,影响LCE3E表达 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
LCE3E缺失或表达下调导致功能丧失,削弱皮肤屏障。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005198 (structural molecule activity) | • GO:0005576 (extracellular region) |
| • GO:0001533 (cornified envelope) | • GO:0030216 (keratinocyte differentiation) |
| • GO:0008544 (epidermis development) |
相关通路
• Keratinocyte differentiation (Reactome: R-HSA-6805567)
• Formation of the cornified envelope (Reactome: R-HSA-6809371)
蛋白质功能简介
LCE3E蛋白是晚期角质化包膜蛋白家族的成员,富含谷氨酰胺和赖氨酸,通过转谷氨酰胺酶交联形成不溶性的角质化包膜,参与皮肤屏障的形成。该蛋白在表皮分化过程中表达,对维持皮肤完整性具有重要作用。