LDLRAP1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
LDLRAP1是低密度脂蛋白受体内吞的关键衔接蛋白,其突变导致常染色体隐性高胆固醇血症。
基因信息卡
| 基因符号 | LDLRAP1 |
|---|---|
| 基因全名 | Low Density Lipoprotein Receptor Adaptor Protein 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1p36.11 |
| NCBI Gene ID | 26119 ncbi.nlm.nih.gov/gene/26119 |
| Ensembl ID | ENSG00000157978 |
| UniProt ID | Q5SW96 |
| OMIM ID | 605747 |
| HGNC ID | 18640 |
| 基因别名 | ARH, ARH2, FHCB1, ARH1 |
基因功能与研究简介
LDLRAP1基因编码低密度脂蛋白受体(LDLR)的衔接蛋白,该蛋白在LDLR介导的LDL内吞过程中发挥关键作用。LDLRAP1通过结合LDLR的胞内域和网格蛋白/AP-2复合物,促进LDLR介导的LDL内吞。LDLRAP1功能缺失导致LDLR无法有效内吞LDL,血浆LDL胆固醇水平升高,引发常染色体隐性高胆固醇血症(ARH)。该基因突变是ARH的主要致病原因。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 常染色体隐性高胆固醇血症 | LDLRAP1功能缺失导致LDLR内吞障碍,LDL清除受阻,血浆LDL胆固醇升高 | 已明确致病 |
| 高胆固醇血症 | LDLRAP1突变导致LDL代谢异常,与高胆固醇血症相关 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肾上腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 胎盘 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系,表达LDLRAP1 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系,表达LDLRAP1 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.432+1G>A | 剪接位点突变 | 罕见 | 导致剪接异常,蛋白功能缺失 |
| p.Arg136* | 无义突变 | 罕见 | 产生截短蛋白,功能缺失 |
| p.Trp22* | 无义突变 | 罕见 | 产生截短蛋白,功能缺失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
LDLRAP1突变导致蛋白功能缺失,无法正常介导LDLR内吞,是ARH的主要致病机制。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明LDLRAP1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明LDLRAP1突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0006897 (endocytosis) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0030117 (membrane coat) | • GO:0008289 (lipid binding) |
| • GO:0005768 (endosome) |
相关通路
• LDLR-mediated endocytosis (Reactome: R-HSA-8964043)
• Lipoprotein metabolism (Reactome: R-HSA-8964043)
蛋白质功能简介
LDLRAP1蛋白由308个氨基酸组成,包含一个磷酸酪氨酸结合(PTB)结构域,该结构域与LDLR胞内域的NPXY基序结合。LDLRAP1通过PTB结构域与LDLR结合,并通过其C端区域与网格蛋白和AP-2复合物相互作用,从而促进LDLR介导的内吞。该蛋白主要在肝脏、肾上腺和胎盘中表达。