NOTCH2NLC基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

NOTCH2NLC基因编码NOTCH2NLC蛋白,参与神经发育,其异常重复扩增与多种神经退行性疾病相关。

基因信息卡

基因符号 NOTCH2NLC
基因全名 notch 2 N-terminal like C
基因类型 protein-coding
染色体位置 1q21.2
NCBI Gene ID 100996718 ncbi.nlm.nih.gov/gene/100996718
Ensembl ID ENSG00000273230
UniProt ID P0DPK4
OMIM ID 618025
HGNC ID 53823
基因别名 NOTCH2NLB, N2NL, NOTCH2NLC

基因功能与研究简介

NOTCH2NLC基因编码NOTCH2NLC蛋白,属于NOTCH2NLA/B/C家族,该家族基因由NOTCH2基因部分复制产生,在人类大脑皮层发育中发挥重要作用。NOTCH2NLC蛋白与NOTCH2蛋白的N端结构域高度相似,可能参与细胞增殖和神经发生。近年来,NOTCH2NLC基因5'UTR区域GGC重复扩增被证实与神经元核内包涵体病(NIID)等多种神经退行性疾病相关,成为研究热点。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经元核内包涵体病(NIID) NOTCH2NLC基因5'UTR区域GGC重复扩增(通常>60次)导致异常蛋白聚集和核内包涵体形成,引起神经退行性病变。 已明确致病
阿尔茨海默病(AD) 部分研究提示NOTCH2NLC重复扩增可能增加AD风险,但证据尚不充分。 潜在关联
帕金森病(PD) 有研究报道NOTCH2NLC重复扩增在PD患者中出现,但因果关系未明。 潜在关联
多系统萎缩(MSA) 少数MSA病例中检测到NOTCH2NLC重复扩增,但关联性需进一步验证。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
大脑皮层 暂无可靠数据 高表达
小脑 暂无可靠数据 中等表达
脊髓 暂无可靠数据 低表达
骨骼肌 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
神经干细胞 暂无可靠数据 高表达
神经元 暂无可靠数据 中等表达
星形胶质细胞 暂无可靠数据 低表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
GGC重复扩增(>60次) 重复扩增 正常人群通常<40次,致病性扩增>60次 功能获得性毒性(gain of function)
GGC重复扩增(40-60次) 中间重复 频率较低 可能为风险因素,功能影响不确定
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

暂无明确证据表明NOTCH2NLC功能缺失突变导致疾病。

Gain of Function(功能获得,GOF)

GGC重复扩增导致异常蛋白聚集和毒性功能获得,是主要致病机制。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据支持显性负性效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0005737 (cytoplasm) • GO:0007399 (nervous system development)

相关通路

Notch signaling pathway (KEGG: hsa04330)
Neurogenesis (GO:0022008)

蛋白质功能简介

NOTCH2NLC蛋白由约300个氨基酸组成,包含一个信号肽和一个与NOTCH2蛋白N端结构域高度相似的区域。该蛋白可能作为分泌性配体或受体参与细胞间信号传导,尤其在神经发育中促进神经干细胞增殖和分化。然而,其具体分子功能尚不完全清楚。在病理状态下,GGC重复扩增导致蛋白在细胞核内形成不溶性包涵体,干扰正常细胞功能,导致神经毒性。

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