PDGFB基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PDGFB编码血小板衍生生长因子B链,参与血管生成、细胞增殖与迁移,其异常与多种癌症和发育性疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PDGFB |
|---|---|
| 基因全名 | platelet derived growth factor subunit B |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 22q13.1 |
| NCBI Gene ID | 5155 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5155 |
| Ensembl ID | ENSG00000100311 |
| UniProt ID | P01127 |
| OMIM ID | 190040 |
| HGNC ID | 8800 |
| 基因别名 | SIS, SSV, c-sis, PDGF2, IBGC5 |
基因功能与研究简介
PDGFB基因编码血小板衍生生长因子(PDGF)的B链,该生长因子以二硫键连接的同源或异源二聚体形式存在,通过结合受体酪氨酸激酶(PDGFRα和PDGFRβ)激活下游信号通路,调控细胞增殖、迁移、存活和血管生成。PDGFB在胚胎发育、组织修复和肿瘤发生中发挥重要作用。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 皮肤纤维肉瘤 | PDGFB基因重排导致融合蛋白(如COL1A1-PDGFB)持续激活PDGFR信号,促进肿瘤生长。 | 已明确致病 |
| 脑白质营养不良伴钙化 | PDGFB突变导致血管平滑肌细胞和周细胞功能障碍,引起颅内钙化和白质病变。 | 已明确致病 |
| 胶质母细胞瘤 | PDGFB过表达或自分泌环激活PDGFR信号,促进肿瘤增殖和血管生成。 | 具有较强研究证据 |
| 脑膜瘤 | PDGFB及其受体在脑膜瘤中高表达,可能参与肿瘤生长。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 血管平滑肌 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 胎盘 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HUVEC | 暂无可靠数据 | 内皮细胞 |
| U87MG | 暂无可靠数据 | 胶质母细胞瘤细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| COL1A1-PDGFB融合 | 基因重排 | 常见于皮肤纤维肉瘤 | Gain of Function |
| p.Arg27Cys | 错义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| p.Arg27His | 错义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
导致PDGFB功能丧失,影响血管发育和细胞信号传导,与脑白质营养不良伴钙化相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
导致PDGFB信号持续激活,促进细胞增殖和肿瘤发生,如COL1A1-PDGFB融合。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005161 (platelet-derived growth factor receptor binding) | • GO:0008083 (growth factor activity) |
| • GO:0005615 (extracellular space) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0048018 (receptor tyrosine kinase signaling pathway) |
相关通路
• hsa04151 (PI3K-Akt signaling pathway)
• hsa04015 (Rap1 signaling pathway)
• hsa04510 (Focal adhesion)
• hsa04810 (Regulation of actin cytoskeleton)
蛋白质功能简介
PDGFB蛋白是血小板衍生生长因子(PDGF)的B链,由241个氨基酸组成,包含信号肽、生长因子结构域和C端保留序列。PDGFB以二硫键连接形成同源二聚体(PDGF-BB)或与A链形成异源二聚体(PDGF-AB),通过结合PDGFRα和PDGFRβ受体激活下游信号通路,包括RAS-MAPK、PI3K-AKT和PLCγ通路,调控细胞增殖、迁移、存活和血管生成。