POMGNT1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
POMGNT1基因编码O-连接甘露糖β-1,2-N-乙酰葡萄糖胺转移酶,参与α-营养不良聚糖的糖基化,其突变导致肌营养不良-营养不良聚糖病,是肌肉-眼-脑疾病的重要致病基因。
基因信息卡
| 基因符号 | POMGNT1 |
|---|---|
| 基因全名 | protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 1 (beta 1,2-) |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 1p34.1 |
| NCBI Gene ID | 55624 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55624 |
| Ensembl ID | ENSG00000185973 |
| UniProt ID | Q8WZA1 |
| OMIM ID | 606822 |
| HGNC ID | 8902 |
| 基因别名 | MEB, GnT I.2, GnT-I.2, LGMD2O, MEBOK, POMGnT1 |
基因功能与研究简介
POMGNT1基因编码O-连接甘露糖β-1,2-N-乙酰葡萄糖胺转移酶,该酶催化α-营养不良聚糖的O-连接甘露糖链上N-乙酰葡萄糖胺的转移,是α-营养不良聚糖糖基化过程中的关键酶。α-营养不良聚糖的糖基化对于维持肌肉、脑和眼等组织的正常功能至关重要。POMGNT1基因突变导致α-营养不良聚糖的糖基化缺陷,进而引发一系列疾病,统称为肌营养不良-营养不良聚糖病(dystroglycanopathy),包括肌肉-眼-脑疾病(muscle-eye-brain disease, MEB)和肢带型肌营养不良症2O型(LGMD2O)。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肌肉-眼-脑疾病(Muscle-Eye-Brain disease, MEB) | POMGNT1基因突变导致α-营养不良聚糖糖基化缺陷,影响基底膜形成,导致严重的神经、肌肉和眼部异常。 | 已明确致病 |
| 肢带型肌营养不良症2O型(Limb-girdle muscular dystrophy type 2O, LGMD2O) | POMGNT1基因突变导致α-营养不良聚糖糖基化缺陷,引起进行性肌无力,主要影响近端肌肉。 | 已明确致病 |
| Walker-Warburg综合征(Walker-Warburg syndrome, WWS) | 部分POMGNT1突变可导致更严重的表型,符合WWS的诊断标准。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 人胚胎肾细胞(HEK293) | 暂无可靠数据 | 常用于重组蛋白表达 |
| 人骨骼肌成肌细胞 | 暂无可靠数据 | 用于肌病研究 |
| 人神经母细胞瘤细胞(SH-SY5Y) | 暂无可靠数据 | 用于神经疾病研究 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1539+1G>A | 剪接位点突变 | 暂无可靠数据 | 导致外显子跳跃,产生截短蛋白,功能丧失 |
| p.Cys308Tyr | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 影响酶活性,功能丧失 |
| p.Arg367His | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 影响酶活性,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
大多数POMGNT1突变导致酶活性丧失或降低,属于功能缺失型突变。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明POMGNT1存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明POMGNT1突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0008375 (acetylglucosaminyltransferase activity) | • GO:0005794 (Golgi apparatus) |
| • GO:0006486 (protein glycosylation) | • GO:0016020 (membrane) |
相关通路
• O-linked glycosylation of alpha-dystroglycan (Reactome: R-HSA-5083635)
蛋白质功能简介
POMGNT1蛋白是O-连接甘露糖β-1,2-N-乙酰葡萄糖胺转移酶,属于糖基转移酶家族。该蛋白定位于高尔基体,催化α-营养不良聚糖上O-连接甘露糖的N-乙酰葡萄糖胺转移,是α-营养不良聚糖糖基化途径中的关键酶。α-营养不良聚糖的糖基化对于维持细胞外基质与细胞骨架的连接至关重要,尤其在骨骼肌、脑和眼中。POMGNT1蛋白由749个氨基酸组成,包含一个N端信号肽、一个跨膜结构域和一个催化结构域。