SARAF基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SARAF(SOCE相关调节因子)是调控钙池操纵性钙内流的关键蛋白,参与免疫、代谢及肿瘤发生,是潜在的治疗靶点。

基因信息卡

基因符号 SARAF
基因全名 SOCE-associated regulatory factor
基因类型 protein-coding
染色体位置 8p12
NCBI Gene ID 114044 ncbi.nlm.nih.gov/gene/114044
Ensembl ID ENSG00000104763
UniProt ID Q96BY9
OMIM ID 614791
HGNC ID 28209
基因别名 TMEM66, FLJ38663

基因功能与研究简介

SARAF(SOCE-associated regulatory factor)基因编码一种内质网跨膜蛋白,是钙池操纵性钙内流(SOCE)的负调控因子。SARAF通过与STIM1相互作用,调节STIM1-Orai1复合物的形成,从而控制钙离子进入细胞。该基因在多种组织中表达,参与免疫应答、细胞增殖和凋亡等过程。研究表明,SARAF的异常表达与多种疾病相关,包括免疫缺陷、肿瘤和代谢性疾病。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
免疫缺陷 SARAF突变导致SOCE失调,影响T细胞功能,可能引起免疫缺陷。 ClinVar
肿瘤 SARAF在多种癌症中表达异常,可能通过调节钙信号影响肿瘤细胞增殖和转移。 COSMIC
代谢性疾病 SARAF参与胰岛素分泌和脂肪细胞分化,可能影响代谢稳态。 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
脾 暂无可靠数据 暂无可靠数据
胸腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
小肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
Jurkat 暂无可靠数据 T细胞白血病细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.341C>T (p.Pro114Leu) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能,需进一步研究
c.457G>A (p.Val153Met) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白稳定性
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变:导致SARAF蛋白功能丧失,可能增强SOCE,引起钙超载。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:增强SARAF抑制功能,可能减弱SOCE,影响细胞信号。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:突变蛋白干扰正常SARAF功能,导致SOCE调节异常。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0016021 integral component of membrane
• GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane • GO:0030314 junctional membrane complex
• GO:0006816 calcium ion transport • GO:0051209 release of sequestered calcium ion into cytosol

相关通路

• Calcium signaling pathway (KEGG: hsa04020)
• SOCE pathway (Reactome: R-HSA-425986)

蛋白质功能简介

SARAF蛋白由339个氨基酸组成,包含一个跨膜结构域,定位于内质网膜。其N端和C端均位于细胞质中,通过C端与STIM1的SOAR区域结合,抑制STIM1-Orai1复合物的形成,从而负调控SOCE。SARAF在静息状态下维持低钙水平,在刺激后调节钙进入,参与多种细胞功能。

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