SARAF基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SARAF(SOCE相关调节因子)是调控钙池操纵性钙内流的关键蛋白,参与免疫、代谢及肿瘤发生,是潜在的治疗靶点。

基因信息卡

基因符号 SARAF
基因全名 SOCE-associated regulatory factor
基因类型 protein-coding
染色体位置 8p12
NCBI Gene ID 114044 ncbi.nlm.nih.gov/gene/114044
Ensembl ID ENSG00000104763
UniProt ID Q96BY9
OMIM ID 614791
HGNC ID 28209
基因别名 TMEM66, FLJ38663

基因功能与研究简介

SARAF(SOCE-associated regulatory factor)基因编码一种内质网跨膜蛋白,是钙池操纵性钙内流(SOCE)的负调控因子。SARAF通过与STIM1相互作用,调节STIM1-Orai1复合物的形成,从而控制钙离子进入细胞。该基因在多种组织中表达,参与免疫应答、细胞增殖和凋亡等过程。研究表明,SARAF的异常表达与多种疾病相关,包括免疫缺陷、肿瘤和代谢性疾病。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
免疫缺陷 SARAF突变导致SOCE失调,影响T细胞功能,可能引起免疫缺陷。 ClinVar
肿瘤 SARAF在多种癌症中表达异常,可能通过调节钙信号影响肿瘤细胞增殖和转移。 COSMIC
代谢性疾病 SARAF参与胰岛素分泌和脂肪细胞分化,可能影响代谢稳态。 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
胸腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
小肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
Jurkat 暂无可靠数据 T细胞白血病细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.341C>T (p.Pro114Leu) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能,需进一步研究
c.457G>A (p.Val153Met) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白稳定性
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变:导致SARAF蛋白功能丧失,可能增强SOCE,引起钙超载。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:增强SARAF抑制功能,可能减弱SOCE,影响细胞信号。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:突变蛋白干扰正常SARAF功能,导致SOCE调节异常。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0016021 integral component of membrane
• GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane • GO:0030314 junctional membrane complex
• GO:0006816 calcium ion transport • GO:0051209 release of sequestered calcium ion into cytosol

相关通路

Calcium signaling pathway (KEGG: hsa04020)
SOCE pathway (Reactome: R-HSA-425986)

蛋白质功能简介

SARAF蛋白由339个氨基酸组成,包含一个跨膜结构域,定位于内质网膜。其N端和C端均位于细胞质中,通过C端与STIM1的SOAR区域结合,抑制STIM1-Orai1复合物的形成,从而负调控SOCE。SARAF在静息状态下维持低钙水平,在刺激后调节钙进入,参与多种细胞功能。

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