SH3GLB1基因|基因功能、疾病关联、突变与细胞自噬研究
SH3GLB1(Endophilin B1)是调控线粒体自噬和细胞凋亡的关键蛋白,与癌症、神经退行性疾病等密切相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SH3GLB1 |
|---|---|
| 基因全名 | SH3 domain containing GRB2 like endophilin B1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1p22.3 |
| NCBI Gene ID | 51100 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51100 |
| Ensembl ID | ENSG00000116285 |
| UniProt ID | Q9Y371 |
| OMIM ID | 609287 |
| HGNC ID | HGNC:10823 |
| 基因别名 | Bif-1, Endophilin-B1, KIAA0495, PPP1R46 |
基因功能与研究简介
SH3GLB1(SH3 domain containing GRB2 like endophilin B1)编码的蛋白质属于endophilin家族,包含一个N-BAR结构域和一个SH3结构域。该蛋白定位于细胞质和线粒体,参与调控线粒体自噬、细胞凋亡、自噬体形成等过程。SH3GLB1通过与BECN1(Beclin 1)相互作用促进自噬,并在凋亡信号通路中发挥作用。研究表明,SH3GLB1在多种癌症中表达异常,可能作为肿瘤抑制因子或促癌因子,具体作用取决于细胞环境。此外,SH3GLB1还参与神经退行性疾病和代谢性疾病的发生。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症 | SH3GLB1在多种癌症中表达下调或缺失,可能通过影响自噬和凋亡促进肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 神经退行性疾病 | SH3GLB1参与线粒体自噬,其功能障碍可能导致神经元损伤,与帕金森病等疾病相关。 | 潜在关联 |
| 代谢性疾病 | SH3GLB1参与脂质代谢和线粒体功能,可能影响胰岛素敏感性。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚肾细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.I41M) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白结构,功能未知 |
| c.456C>T (p.R152W) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响SH3结构域功能 |
| c.789delC (p.L263fs) | 移码突变 | 暂无可靠数据 | 导致蛋白截短,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变:导致SH3GLB1蛋白表达减少或功能丧失,可能影响自噬和凋亡,与肿瘤发生相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变:目前暂无明确证据表明SH3GLB1存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变:可能干扰正常蛋白功能,但暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005737 cytoplasm |
| • GO:0005739 mitochondrion | • GO:0006914 autophagy |
| • GO:0006915 apoptotic process | • GO:0016020 membrane |
| • GO:0031410 cytoplasmic vesicle |
相关通路
• Autophagy - animal (KEGG: hsa04140)
• Mitophagy - animal (KEGG: hsa04137)
• Apoptosis (KEGG: hsa04210)
蛋白质功能简介
SH3GLB1蛋白(Endophilin B1)由SH3GLB1基因编码,包含N-BAR结构域和SH3结构域。该蛋白定位于细胞质和线粒体,参与调控线粒体自噬、细胞凋亡和自噬体形成。SH3GLB1通过与BECN1相互作用促进自噬,并在凋亡信号通路中发挥作用。研究表明,SH3GLB1在多种癌症中表达异常,可能作为肿瘤抑制因子或促癌因子,具体作用取决于细胞环境。此外,SH3GLB1还参与神经退行性疾病和代谢性疾病的发生。