SLC25A38基因|线粒体甘氨酸转运、铁粒幼细胞性贫血与基因编辑研究
SLC25A38编码线粒体甘氨酸转运蛋白,其缺陷导致常染色体隐性铁粒幼细胞性贫血,是血红素合成关键调控因子。
基因信息卡
| 基因符号 | SLC25A38 |
|---|---|
| 基因全名 | solute carrier family 25 member 38 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 3p22.1 |
| NCBI Gene ID | 54977 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54977 |
| Ensembl ID | ENSG00000144659 |
| UniProt ID | Q96DW6 |
| OMIM ID | 610819 |
| HGNC ID | 26053 |
| 基因别名 | FLJ20516 |
基因功能与研究简介
SLC25A38基因编码线粒体内膜上的甘氨酸转运蛋白,属于线粒体载体家族(SLC25)。该蛋白在红细胞发育过程中,将甘氨酸转运至线粒体基质,为δ-氨基乙酰丙酸合成酶(ALAS2)提供底物,参与血红素生物合成的第一步。SLC25A38功能缺失导致线粒体基质内甘氨酸缺乏,进而影响血红素合成,引发铁粒幼细胞性贫血。该基因主要在红细胞前体细胞中高表达,在其他组织中表达较低。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 常染色体隐性铁粒幼细胞性贫血(Autosomal recessive sideroblastic anemia) | SLC25A38基因纯合或复合杂合突变导致线粒体甘氨酸转运功能丧失,血红素合成受阻,线粒体铁积累形成环状铁粒幼细胞,引发贫血。 | 已明确致病(OMIM 610819;ClinVar) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 高表达(红细胞前体) |
| 外周血 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 其他组织 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| K562(红白血病细胞系) | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.676C>T (p.Arg226Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.698G>A (p.Trp233Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.382G>A (p.Gly128Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能为Loss of Function |
| c.560G>A (p.Arg187His) | 错义突变 | 罕见 | 可能为Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
导致SLC25A38蛋白功能丧失或显著降低,包括无义突变、移码突变、剪接位点突变等,破坏甘氨酸转运能力,引发铁粒幼细胞性贫血。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明SLC25A38存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明SLC25A38突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0015293 (symporter activity) | • GO:0005743 (mitochondrial inner membrane) |
| • GO:0006783 (heme biosynthetic process) | • GO:0015886 (heme transport) |
相关通路
• Heme biosynthesis (Reactome: R-HSA-189451)
蛋白质功能简介
SLC25A38蛋白由316个氨基酸组成,分子量约34 kDa,定位于线粒体内膜。它属于SLC25线粒体载体家族,具有典型的六次跨膜结构域。该蛋白特异性地转运甘氨酸进入线粒体基质,为ALAS2提供底物,是红细胞血红素合成的限速步骤之一。SLC25A38功能缺失导致甘氨酸供应不足,血红素合成受阻,线粒体铁积累,形成环状铁粒幼细胞。