SLFN13基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SLFN13是一种干扰素诱导的Schlafen家族蛋白,参与调控细胞增殖、病毒复制和免疫应答,与多种癌症和病毒感染相关。

基因信息卡

基因符号 SLFN13
基因全名 Schlafen family member 13
基因类型 protein-coding
染色体位置 17q12
NCBI Gene ID 146857 ncbi.nlm.nih.gov/gene/146857
Ensembl ID ENSG00000154760
UniProt ID Q68D06
OMIM ID 暂无可靠数据
HGNC ID HGNC:26010
基因别名 FLJ11286, MGC126851

基因功能与研究简介

SLFN13(Schlafen family member 13)是Schlafen蛋白家族的一员,该家族蛋白与细胞增殖、分化、免疫调节和抗病毒反应密切相关。SLFN13具有DNA/RNA解旋酶活性和ATP酶活性,可能参与调控DNA复制和修复。研究表明,SLFN13在多种肿瘤中表达异常,并与病毒感染(如HIV-1)的抑制有关。此外,SLFN13可能通过影响细胞周期和凋亡参与肿瘤发生发展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肝细胞癌 SLFN13在肝细胞癌中表达下调,可能通过调控细胞增殖和凋亡影响肿瘤进展。 较强研究证据
HIV-1感染 SLFN13具有抗HIV-1活性,通过抑制病毒蛋白合成和病毒粒子产生。 较强研究证据
乳腺癌 SLFN13在乳腺癌中表达水平与预后相关,可能作为潜在生物标志物。 潜在关联
结直肠癌 SLFN13在结直肠癌中表达异常,可能参与肿瘤抑制。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
脾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
胸腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
外周血 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
Jurkat 暂无可靠数据 T细胞白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
c.567A>G (p.Ile189Val) 错义突变 低频 可能影响蛋白结构,功能未知
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,功能丧失。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005524 (ATP binding) • GO:0004386 (helicase activity)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0009615 (response to virus) • GO:0045087 (innate immune response)

相关通路

• 暂无明确Pathway ID

蛋白质功能简介

SLFN13蛋白属于Schlafen家族,含有解旋酶结构域和ATP结合位点。该蛋白定位于细胞核和细胞质,可能参与DNA/RNA代谢和免疫应答。研究表明,SLFN13通过其解旋酶活性抑制HIV-1的复制,并在多种肿瘤中发挥抑癌作用。其表达受干扰素诱导,提示其在抗病毒和抗肿瘤免疫中具有重要作用。

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