SMARCAD1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SMARCAD1编码ATP依赖性染色质重塑因子,参与DNA修复和基因表达调控,其突变与皮肤和牙齿发育异常相关。

基因信息卡

基因符号 SMARCAD1
基因全名 SWI/SNF-related, matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin, subfamily a, containing DEAD/H box 1
基因类型 蛋白编码基因
染色体位置 4q22.3
NCBI Gene ID 56916 ncbi.nlm.nih.gov/gene/56916
Ensembl ID ENSG00000163125
UniProt ID Q9H4L7
OMIM ID 612761
HGNC ID 18398
基因别名 ETL1, HEL1, SMARCAD1

基因功能与研究简介

SMARCAD1基因编码一种ATP依赖性染色质重塑因子,属于SNF2家族。该蛋白参与DNA损伤修复、基因转录调控和染色质结构维持。SMARCAD1在多种组织中表达,尤其在皮肤和牙齿中高表达。其突变与常染色体显性遗传性皮肤病和牙齿发育异常相关。此外,SMARCAD1在多种癌症中表达异常,可能参与肿瘤发生发展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
常染色体显性遗传性皮肤病 SMARCAD1突变导致功能丧失,影响DNA修复和表皮分化,导致皮肤角化异常。 已明确致病
牙齿发育异常 SMARCAD1突变影响牙釉质形成,导致牙齿形态和结构异常。 已明确致病
癌症 SMARCAD1在多种肿瘤中表达下调或突变,可能通过影响基因组稳定性促进肿瘤发生。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
皮肤 暂无可靠数据 高表达
牙齿 暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HaCaT 暂无可靠数据 角质形成细胞系
SCC-25 暂无可靠数据 口腔鳞癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.567_568del (p.Glu190fs) 移码突变 罕见 Loss of Function
c.789A>G (p.Ile263Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,导致蛋白截短或降解,影响染色质重塑活性。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004386 (helicase activity) • GO:0005524 (ATP binding)
• GO:0006338 (chromatin remodeling) • GO:0006281 (DNA repair)
• GO:0005634 (nucleus)

相关通路

hsa03420: Nucleotide excision repair
hsa05200: Pathways in cancer

蛋白质功能简介

SMARCAD1蛋白属于SNF2家族,具有ATP酶和解旋酶活性,参与染色质重塑和DNA修复。该蛋白在DNA损伤应答中发挥重要作用,通过重塑染色质结构促进修复蛋白的募集。SMARCAD1还参与基因转录调控,影响细胞分化和发育。

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