SMARCAD1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SMARCAD1编码ATP依赖性染色质重塑因子,参与DNA修复和基因表达调控,其突变与皮肤和牙齿发育异常相关。

基因信息卡

基因符号 SMARCAD1
基因全名 SWI/SNF-related, matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin, subfamily a, containing DEAD/H box 1
基因类型 蛋白编码基因
染色体位置 4q22.3
NCBI Gene ID 56916 ncbi.nlm.nih.gov/gene/56916
Ensembl ID ENSG00000163125
UniProt ID Q9H4L7
OMIM ID 612761
HGNC ID 18398
基因别名 ETL1, HEL1, SMARCAD1

基因功能与研究简介

SMARCAD1基因编码一种ATP依赖性染色质重塑因子,属于SNF2家族。该蛋白参与DNA损伤修复、基因转录调控和染色质结构维持。SMARCAD1在多种组织中表达,尤其在皮肤和牙齿中高表达。其突变与常染色体显性遗传性皮肤病和牙齿发育异常相关。此外,SMARCAD1在多种癌症中表达异常,可能参与肿瘤发生发展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
常染色体显性遗传性皮肤病 SMARCAD1突变导致功能丧失,影响DNA修复和表皮分化,导致皮肤角化异常。 已明确致病
牙齿发育异常 SMARCAD1突变影响牙釉质形成,导致牙齿形态和结构异常。 已明确致病
癌症 SMARCAD1在多种肿瘤中表达下调或突变,可能通过影响基因组稳定性促进肿瘤发生。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
皮肤 暂无可靠数据 高表达
牙齿 暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
肺 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HaCaT 暂无可靠数据 角质形成细胞系
SCC-25 暂无可靠数据 口腔鳞癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.567_568del (p.Glu190fs) 移码突变 罕见 Loss of Function
c.789A>G (p.Ile263Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,导致蛋白截短或降解,影响染色质重塑活性。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004386 (helicase activity) • GO:0005524 (ATP binding)
• GO:0006338 (chromatin remodeling) • GO:0006281 (DNA repair)
• GO:0005634 (nucleus)

相关通路

• hsa03420: Nucleotide excision repair
• hsa05200: Pathways in cancer

蛋白质功能简介

SMARCAD1蛋白属于SNF2家族,具有ATP酶和解旋酶活性,参与染色质重塑和DNA修复。该蛋白在DNA损伤应答中发挥重要作用,通过重塑染色质结构促进修复蛋白的募集。SMARCAD1还参与基因转录调控,影响细胞分化和发育。

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