STK36基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
STK36(丝氨酸/苏氨酸激酶36)是Hedgehog信号通路的关键调控因子,参与纤毛发生和胚胎发育,其突变与多种发育异常和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | STK36 |
|---|---|
| 基因全名 | serine/threonine kinase 36 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 2q35 |
| NCBI Gene ID | 27148 ncbi.nlm.nih.gov/gene/27148 |
| Ensembl ID | ENSG00000163349 |
| UniProt ID | Q9NRP7 |
| OMIM ID | 607652 |
| HGNC ID | 15517 |
| 基因别名 | KIAA1278, Fused homolog, Fu |
基因功能与研究简介
STK36(丝氨酸/苏氨酸激酶36)是Hedgehog信号通路的关键调控因子,在纤毛发生和胚胎发育中发挥重要作用。该基因编码的蛋白定位于纤毛基体,参与Gli转录因子的激活和纤毛内运输。STK36功能异常与多种发育异常(如内脏异位)和癌症(如髓母细胞瘤)相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 内脏异位 | STK36突变导致纤毛功能障碍,影响左右轴建立,与内脏异位相关。 | ClinVar, OMIM |
| 髓母细胞瘤 | STK36在Hedgehog通路中作为GLI激活因子,其异常表达或突变可能促进肿瘤发生。 | COSMIC, PubMed |
| 原发性纤毛运动障碍 | STK36突变可能影响纤毛运动,但证据有限。 | 暂无明确证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| IMR90 | 暂无可靠数据 | 成纤维细胞 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Lys412Glu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响激酶活性 |
| c.567delC (p.Leu190fs) | 移码突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.890C>T (p.Thr297Met) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
导致STK36蛋白功能丧失或减弱,影响Hedgehog信号通路,与发育异常相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前尚无明确证据表明STK36存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
目前尚无明确证据表明STK36存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004672 (protein kinase activity) | • GO:0005524 (ATP binding) |
| • GO:0005813 (centrosome) | • GO:0005929 (cilium) |
| • GO:0007224 (smoothened signaling pathway) | • GO:0045880 (positive regulation of smoothened signaling pathway) |
相关通路
• Hedgehog signaling pathway (KEGG: hsa04340)
• Cilium assembly (GO:0060271)
蛋白质功能简介
STK36蛋白是一种丝氨酸/苏氨酸激酶,属于GSK3/MAPK激酶家族。它定位于纤毛基体,与KIF7相互作用,参与Hedgehog信号通路的调控。STK36通过磷酸化GLI转录因子,促进其激活形式,从而调控下游基因表达。在胚胎发育中,STK36对于纤毛功能和左右轴建立至关重要。