TET2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TET2是DNA去甲基化关键酶,在血液肿瘤和炎症性疾病中发挥重要作用。

基因信息卡

基因符号 TET2
基因全名 tet methylcytosine dioxygenase 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 4q24
NCBI Gene ID 54790 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54790
Ensembl ID ENSG00000168769
UniProt ID Q6N021
OMIM ID 612839
HGNC ID 25941
基因别名 KIAA1546

基因功能与研究简介

TET2基因编码甲基胞嘧啶双加氧酶2,属于TET蛋白家族,催化5-甲基胞嘧啶(5mC)氧化为5-羟甲基胞嘧啶(5hmC),是DNA主动去甲基化的重要步骤。TET2在造血干细胞中高表达,调控造血分化,其功能丧失与多种髓系恶性肿瘤相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
骨髓增生异常综合征 TET2功能丧失性突变导致DNA高甲基化,影响造血分化,促进肿瘤发生。 已明确致病
急性髓系白血病 TET2突变导致5hmC水平降低,异常造血增殖,与AML发病相关。 已明确致病
慢性粒单核细胞白血病 TET2突变常见于CMML,参与疾病发生。 已明确致病
骨髓增殖性肿瘤 TET2突变与MPN相关,可能协同JAK2突变影响疾病表型。 较强研究证据
血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤 TET2突变在AITL中高频出现,参与肿瘤发生。 较强研究证据
炎症性疾病 TET2功能异常可能影响免疫调节,与炎症相关,但证据尚不充分。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨髓 暂无可靠数据 高表达
外周血 暂无可靠数据 中等表达
脾脏 暂无可靠数据 中等表达
胸腺 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
K562 暂无可靠数据 慢性髓系白血病细胞系
HL-60 暂无可靠数据 急性髓系白血病细胞系
THP-1 暂无可靠数据 单核细胞白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.4501C>T (p.Arg1501Ter) 无义突变 常见于髓系肿瘤 Loss of Function
c.4582C>T (p.Arg1528Ter) 无义突变 常见于髓系肿瘤 Loss of Function
c.5161C>T (p.Arg1721Ter) 无义突变 常见于髓系肿瘤 Loss of Function
c.5640_5641del (p.Gly1881fs) 移码突变 偶见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

TET2突变多为功能丧失型,导致酶活性降低或缺失,使5hmC水平下降,DNA甲基化异常,促进肿瘤发生。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明TET2存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明TET2突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 DNA binding • GO:0005506 iron ion binding
• GO:0005515 protein binding • GO:0005634 nucleus
• GO:0005737 cytoplasm • GO:0006306 DNA methylation
• GO:0016491 oxidoreductase activity • GO:0035515 oxidative RNA demethylation
• GO:0046872 metal ion binding • GO:0055114 oxidation-reduction process

相关通路

Cytosine methylation (WP1234)
DNA methylation and transcriptional repression (WP1235)

蛋白质功能简介

TET2蛋白属于TET家族,含有双加氧酶结构域,依赖Fe2+和α-酮戊二酸催化5mC氧化为5hmC。TET2在造血干细胞中高表达,调控造血分化,其功能丧失导致DNA高甲基化,影响基因表达,促进肿瘤发生。

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