TET2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TET2是DNA去甲基化关键酶,在血液肿瘤和炎症性疾病中发挥重要作用。
基因信息卡
| 基因符号 | TET2 |
|---|---|
| 基因全名 | tet methylcytosine dioxygenase 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 4q24 |
| NCBI Gene ID | 54790 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54790 |
| Ensembl ID | ENSG00000168769 |
| UniProt ID | Q6N021 |
| OMIM ID | 612839 |
| HGNC ID | 25941 |
| 基因别名 | KIAA1546 |
基因功能与研究简介
TET2基因编码甲基胞嘧啶双加氧酶2,属于TET蛋白家族,催化5-甲基胞嘧啶(5mC)氧化为5-羟甲基胞嘧啶(5hmC),是DNA主动去甲基化的重要步骤。TET2在造血干细胞中高表达,调控造血分化,其功能丧失与多种髓系恶性肿瘤相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 骨髓增生异常综合征 | TET2功能丧失性突变导致DNA高甲基化,影响造血分化,促进肿瘤发生。 | 已明确致病 |
| 急性髓系白血病 | TET2突变导致5hmC水平降低,异常造血增殖,与AML发病相关。 | 已明确致病 |
| 慢性粒单核细胞白血病 | TET2突变常见于CMML,参与疾病发生。 | 已明确致病 |
| 骨髓增殖性肿瘤 | TET2突变与MPN相关,可能协同JAK2突变影响疾病表型。 | 较强研究证据 |
| 血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤 | TET2突变在AITL中高频出现,参与肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 炎症性疾病 | TET2功能异常可能影响免疫调节,与炎症相关,但证据尚不充分。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 外周血 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 胸腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| K562 | 暂无可靠数据 | 慢性髓系白血病细胞系 |
| HL-60 | 暂无可靠数据 | 急性髓系白血病细胞系 |
| THP-1 | 暂无可靠数据 | 单核细胞白血病细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.4501C>T (p.Arg1501Ter) | 无义突变 | 常见于髓系肿瘤 | Loss of Function |
| c.4582C>T (p.Arg1528Ter) | 无义突变 | 常见于髓系肿瘤 | Loss of Function |
| c.5161C>T (p.Arg1721Ter) | 无义突变 | 常见于髓系肿瘤 | Loss of Function |
| c.5640_5641del (p.Gly1881fs) | 移码突变 | 偶见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
TET2突变多为功能丧失型,导致酶活性降低或缺失,使5hmC水平下降,DNA甲基化异常,促进肿瘤发生。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明TET2存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明TET2突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 DNA binding | • GO:0005506 iron ion binding |
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0005737 cytoplasm | • GO:0006306 DNA methylation |
| • GO:0016491 oxidoreductase activity | • GO:0035515 oxidative RNA demethylation |
| • GO:0046872 metal ion binding | • GO:0055114 oxidation-reduction process |
相关通路
• Cytosine methylation (WP1234)
• DNA methylation and transcriptional repression (WP1235)
蛋白质功能简介
TET2蛋白属于TET家族,含有双加氧酶结构域,依赖Fe2+和α-酮戊二酸催化5mC氧化为5hmC。TET2在造血干细胞中高表达,调控造血分化,其功能丧失导致DNA高甲基化,影响基因表达,促进肿瘤发生。