TMIGD1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TMIGD1是一种细胞黏附分子,在肠道和肾脏中高表达,可能参与细胞黏附、迁移和肿瘤抑制。
基因信息卡
| 基因符号 | TMIGD1 |
|---|---|
| 基因全名 | transmembrane and immunoglobulin domain containing 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 17q11.2 |
| NCBI Gene ID | 100287632 ncbi.nlm.nih.gov/gene/100287632 |
| Ensembl ID | ENSG00000261609 |
| UniProt ID | Q6UXZ0 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | HGNC:37225 |
| 基因别名 | TMIGD1, MGC13057, PRO1855 |
基因功能与研究简介
TMIGD1(transmembrane and immunoglobulin domain containing 1)是一种I型跨膜蛋白,属于免疫球蛋白超家族。该基因位于染色体17q11.2,编码的蛋白包含一个信号肽、一个免疫球蛋白样结构域、一个跨膜区和一个胞内尾。TMIGD1在正常肠道和肾脏上皮细胞中高表达,可能参与细胞黏附、细胞迁移和细胞极性维持。研究表明,TMIGD1在多种肿瘤中表达下调,可能作为肿瘤抑制因子发挥作用。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 结直肠癌 | TMIGD1在结直肠癌中表达下调,可能通过影响细胞黏附促进肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 肾细胞癌 | TMIGD1在肾细胞癌中表达降低,与肿瘤分期和预后相关。 | 较强研究证据 |
| 胃癌 | TMIGD1在胃癌中表达下调,可能参与肿瘤发生。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 小肠 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| Caco-2 | 暂无可靠数据 | 结直肠腺癌细胞系 |
| HK-2 | 暂无可靠数据 | 肾近端小管上皮细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123C>T (p.Arg41Cys) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白结构,功能未知 |
| c.456delA (p.Lys152fs) | 移码突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
TMIGD1的移码突变或剪接位点突变可能导致蛋白功能丧失,从而影响细胞黏附,促进肿瘤进展。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明TMIGD1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明TMIGD1存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0007155 (cell adhesion) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0005515 (protein binding) |
相关通路
• 暂无明确通路数据
蛋白质功能简介
TMIGD1蛋白是一种跨膜糖蛋白,属于免疫球蛋白超家族。其胞外区含有一个免疫球蛋白样结构域,可能介导同嗜性或异嗜性细胞黏附。胞内尾较短,可能参与信号转导。TMIGD1在正常上皮细胞中定位于细胞膜,可能通过维持细胞极性抑制肿瘤发生。