TSC1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TSC1基因编码错构瘤蛋白,是结节性硬化症的关键致病基因,参与调控mTOR信号通路,影响细胞生长与增殖。

基因信息卡

基因符号 TSC1
基因全名 TSC complex subunit 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 9q34.13
NCBI Gene ID 7248 ncbi.nlm.nih.gov/gene/7248
Ensembl ID ENSG00000165699
UniProt ID Q92574
OMIM ID 605284
HGNC ID 11830
基因别名 KIAA0243, LAM, TSC

基因功能与研究简介

TSC1基因编码错构瘤蛋白(hamartin),与TSC2基因编码的结节蛋白(tuberin)形成复合物,作为mTOR信号通路的负调控因子,抑制细胞生长和增殖。TSC1基因突变可导致结节性硬化症(Tuberous Sclerosis Complex, TSC),并增加多种肿瘤的发生风险。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
结节性硬化症 TSC1基因突变导致错构瘤蛋白功能丧失,无法抑制mTOR信号通路,引起细胞过度增殖和分化异常,导致多器官错构瘤形成。 已明确致病
淋巴管平滑肌瘤病 TSC1基因突变与淋巴管平滑肌瘤病(LAM)相关,尤其在肺部表现明显。 已明确致病
肾细胞癌 TSC1基因突变与肾细胞癌的发生相关,尤其在TSC患者中。 具有较强研究证据
膀胱癌 TSC1基因突变在膀胱癌中频繁出现,可能作为肿瘤抑制基因。 具有较强研究证据
癫痫 TSC1基因突变导致mTOR通路过度激活,与结节性硬化症相关的癫痫发作有关。 已明确致病

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脑 暂无可靠数据 高表达
肾 暂无可靠数据 中等表达
肺 暂无可靠数据 中等表达
心脏 暂无可靠数据 低表达
肝 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1900C>T (p.Arg634Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.2074C>T (p.Arg692Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1555C>T (p.Arg519Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.2101delA (p.Thr701ProfsTer5) 移码突变 罕见 Loss of Function
c.2385_2386delAA (p.Lys795AsnfsTer2) 移码突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

TSC1基因突变导致错构瘤蛋白功能丧失,无法抑制mTOR信号通路,是结节性硬化症的主要致病机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明TSC1存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明TSC1突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0031932 (TORC1 signaling) • GO:0043547 (positive regulation of GTPase activity)
• GO:0008284 (positive regulation of cell population proliferation)

相关通路

• PI3K-Akt signaling pathway (KEGG: hsa04151)
• mTOR signaling pathway (KEGG: hsa04150)
• AMPK signaling pathway (KEGG: hsa04152)

蛋白质功能简介

TSC1蛋白(hamartin)由1164个氨基酸组成,分子量约130 kDa。它包含多个功能域,包括N端的跨膜结构域、卷曲螺旋结构域和C端的GAP相关结构域。TSC1与TSC2形成复合物,通过TSC2的GAP活性抑制Rheb,从而负调控mTORC1信号通路。TSC1蛋白在细胞生长、增殖和分化中发挥关键作用。

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