TSC1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TSC1基因编码错构瘤蛋白,是结节性硬化症的关键致病基因,参与调控mTOR信号通路,影响细胞生长与增殖。

基因信息卡

基因符号 TSC1
基因全名 TSC complex subunit 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 9q34.13
NCBI Gene ID 7248 ncbi.nlm.nih.gov/gene/7248
Ensembl ID ENSG00000165699
UniProt ID Q92574
OMIM ID 605284
HGNC ID 11830
基因别名 KIAA0243, LAM, TSC

基因功能与研究简介

TSC1基因编码错构瘤蛋白(hamartin),与TSC2基因编码的结节蛋白(tuberin)形成复合物,作为mTOR信号通路的负调控因子,抑制细胞生长和增殖。TSC1基因突变可导致结节性硬化症(Tuberous Sclerosis Complex, TSC),并增加多种肿瘤的发生风险。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
结节性硬化症 TSC1基因突变导致错构瘤蛋白功能丧失,无法抑制mTOR信号通路,引起细胞过度增殖和分化异常,导致多器官错构瘤形成。 已明确致病
淋巴管平滑肌瘤病 TSC1基因突变与淋巴管平滑肌瘤病(LAM)相关,尤其在肺部表现明显。 已明确致病
肾细胞癌 TSC1基因突变与肾细胞癌的发生相关,尤其在TSC患者中。 具有较强研究证据
膀胱癌 TSC1基因突变在膀胱癌中频繁出现,可能作为肿瘤抑制基因。 具有较强研究证据
癫痫 TSC1基因突变导致mTOR通路过度激活,与结节性硬化症相关的癫痫发作有关。 已明确致病

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
心脏 暂无可靠数据 低表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1900C>T (p.Arg634Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.2074C>T (p.Arg692Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1555C>T (p.Arg519Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.2101delA (p.Thr701ProfsTer5) 移码突变 罕见 Loss of Function
c.2385_2386delAA (p.Lys795AsnfsTer2) 移码突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

TSC1基因突变导致错构瘤蛋白功能丧失,无法抑制mTOR信号通路,是结节性硬化症的主要致病机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明TSC1存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明TSC1突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0031932 (TORC1 signaling) • GO:0043547 (positive regulation of GTPase activity)
• GO:0008284 (positive regulation of cell population proliferation)

相关通路

PI3K-Akt signaling pathway (KEGG: hsa04151)
mTOR signaling pathway (KEGG: hsa04150)
AMPK signaling pathway (KEGG: hsa04152)

蛋白质功能简介

TSC1蛋白(hamartin)由1164个氨基酸组成,分子量约130 kDa。它包含多个功能域,包括N端的跨膜结构域、卷曲螺旋结构域和C端的GAP相关结构域。TSC1与TSC2形成复合物,通过TSC2的GAP活性抑制Rheb,从而负调控mTORC1信号通路。TSC1蛋白在细胞生长、增殖和分化中发挥关键作用。

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