TSC22D1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TSC22D1(TSC22 Domain Family Member 1)是一种参与细胞凋亡、应激反应和转录调控的蛋白,在多种癌症中表达异常,可能作为肿瘤抑制因子或促癌因子,是潜在的治疗靶点。

基因信息卡

基因符号 TSC22D1
基因全名 TSC22 domain family member 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 13q14.11
NCBI Gene ID 8848 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8848
Ensembl ID ENSG00000102804
UniProt ID Q15788
OMIM ID 607715
HGNC ID 16839
基因别名 TSC22, TGFB1I4, FLJ22471

基因功能与研究简介

TSC22D1(TSC22 Domain Family Member 1)基因编码一种含有TSC22结构域的蛋白,该蛋白在多种组织中表达,参与细胞凋亡、应激反应、转录调控等过程。TSC22D1最初被鉴定为转化生长因子-β(TGF-β)诱导的转录抑制因子,在多种癌症中表达异常,可能作为肿瘤抑制因子或促癌因子,具体作用取决于细胞类型和肿瘤微环境。研究表明,TSC22D1在多种肿瘤中表达下调,与不良预后相关,但也有些肿瘤中表达上调。此外,TSC22D1还参与调控细胞周期、细胞迁移和侵袭等过程。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症(多种类型) TSC22D1在多种癌症中表达异常,可能通过调控细胞凋亡、增殖和迁移参与肿瘤发生发展。 多项研究(PMID: 12368474, 15616553, 20089883)
糖尿病肾病 TSC22D1在肾脏中高表达,可能参与高糖诱导的肾小管上皮细胞损伤和纤维化。 研究证据(PMID: 23451068)
心血管疾病 TSC22D1在心脏中表达,可能参与心肌肥厚和纤维化过程。 研究证据(PMID: 20566837)

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肾脏 暂无可靠数据 高表达(基于免疫组化)
心脏 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 内源性表达
HeLa 暂无可靠数据 内源性表达
MCF7 暂无可靠数据 内源性表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.I41M) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但临床意义未明
c.456C>T (p.R153*) 无义突变 罕见 导致截短蛋白,可能功能丧失
c.789delC (p.L264fs) 移码突变 罕见 导致截短蛋白,可能功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变、移码突变等导致蛋白截短或功能丧失,可能影响肿瘤抑制功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前暂无明确证据表明TSC22D1存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

目前暂无明确证据表明TSC22D1突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 (DNA binding) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0006355 (regulation of transcription • DNA-templated)
• GO:0006915 (apoptotic process) • GO:0006950 (response to stress)

相关通路

TGF-beta signaling pathway (hsa04350)
Apoptosis (hsa04210)

蛋白质功能简介

TSC22D1蛋白属于TSC22结构域家族,包含一个亮氨酸拉链样结构域,可能参与蛋白-蛋白相互作用。该蛋白在细胞核和细胞质中均有定位,可能作为转录调控因子参与TGF-β信号通路。TSC22D1在多种组织中表达,尤其在肾脏和心脏中高表达。研究表明,TSC22D1在多种癌症中表达下调,可能通过抑制细胞增殖和诱导凋亡发挥肿瘤抑制功能。此外,TSC22D1还参与应激反应和细胞迁移等过程。

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