USP54基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

USP54编码去泛素化酶,参与蛋白质稳态调控,与多种癌症和神经发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 USP54
基因全名 ubiquitin specific peptidase 54
基因类型 protein-coding
染色体位置 10q22.2
NCBI Gene ID 84062 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84062
Ensembl ID ENSG00000107614
UniProt ID Q70EL4
OMIM ID 617436
HGNC ID 26425
基因别名 USP54, FLJ22624

基因功能与研究简介

USP54(ubiquitin specific peptidase 54)编码去泛素化酶,属于泛素特异性蛋白酶家族。该酶通过去除靶蛋白上的泛素链,参与蛋白质稳态、DNA损伤修复、细胞周期调控等过程。USP54在多种组织中表达,其异常表达与肿瘤发生和神经发育障碍相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 USP54在多种癌症中表达异常,可能通过调控底物蛋白稳定性影响肿瘤发生发展。 较强研究证据
神经发育障碍 USP54突变与智力障碍和自闭症谱系障碍相关。 较强研究证据
暂无明确证据 暂无明确证据 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.2345delC (p.Pro782LeufsTer5) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,可能丧失去泛素化酶活性
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失型突变):导致USP54蛋白活性降低或丧失,可能影响底物蛋白的泛素化调控,与疾病发生相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得型突变):目前暂无明确证据表明USP54存在此类突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性突变):目前暂无明确证据表明USP54存在此类突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity) • GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0005737 (cytoplasm)

相关通路

Ubiquitin-mediated proteolysis (KEGG: hsa04120)
Proteasome (KEGG: hsa03050)

蛋白质功能简介

USP54蛋白属于去泛素化酶家族,包含一个保守的肽酶C19结构域。该蛋白可能通过去除底物上的泛素链,调控蛋白质降解和信号转导。USP54在多种组织中表达,其亚细胞定位可能包括细胞核和细胞质。目前对其具体底物和生物学功能的研究仍在进行中。

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