USP54基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

USP54编码去泛素化酶,参与蛋白质稳态调控,与多种癌症和神经发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 USP54
基因全名 ubiquitin specific peptidase 54
基因类型 protein-coding
染色体位置 10q22.2
NCBI Gene ID 84062 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84062
Ensembl ID ENSG00000107614
UniProt ID Q70EL4
OMIM ID 617436
HGNC ID 26425
基因别名 USP54, FLJ22624

基因功能与研究简介

USP54(ubiquitin specific peptidase 54)编码去泛素化酶,属于泛素特异性蛋白酶家族。该酶通过去除靶蛋白上的泛素链,参与蛋白质稳态、DNA损伤修复、细胞周期调控等过程。USP54在多种组织中表达,其异常表达与肿瘤发生和神经发育障碍相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 USP54在多种癌症中表达异常,可能通过调控底物蛋白稳定性影响肿瘤发生发展。 较强研究证据
神经发育障碍 USP54突变与智力障碍和自闭症谱系障碍相关。 较强研究证据
暂无明确证据 暂无明确证据 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脑 暂无可靠数据 暂无可靠数据
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.2345delC (p.Pro782LeufsTer5) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,可能丧失去泛素化酶活性
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失型突变):导致USP54蛋白活性降低或丧失,可能影响底物蛋白的泛素化调控,与疾病发生相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得型突变):目前暂无明确证据表明USP54存在此类突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性突变):目前暂无明确证据表明USP54存在此类突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity) • GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0005737 (cytoplasm)

相关通路

• Ubiquitin-mediated proteolysis (KEGG: hsa04120)
• Proteasome (KEGG: hsa03050)

蛋白质功能简介

USP54蛋白属于去泛素化酶家族,包含一个保守的肽酶C19结构域。该蛋白可能通过去除底物上的泛素链,调控蛋白质降解和信号转导。USP54在多种组织中表达,其亚细胞定位可能包括细胞核和细胞质。目前对其具体底物和生物学功能的研究仍在进行中。

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