VAC14基因|功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

VAC14是PIKfyve复合物的关键调控因子,参与磷脂酰肌醇代谢,其突变导致神经退行性疾病。

基因信息卡

基因符号 VAC14
基因全名 VAC14 component of PIKFYVE complex
基因类型 protein-coding
染色体位置 16q22.1
NCBI Gene ID 55697 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55697
Ensembl ID ENSG00000103035
UniProt ID Q08AM6
OMIM ID 608632
HGNC ID 16707
基因别名 TAX1BP2, ArPIKfyve

基因功能与研究简介

VAC14基因编码一种支架蛋白,是磷脂酰肌醇3,5-二磷酸(PI(3,5)P2)合成所必需的PIKfyve复合物的组成部分。该蛋白与PIKfyve和FIG4相互作用,调控内体/溶酶体途径中的脂质代谢。VAC14功能缺失或突变可导致神经退行性疾病,如儿童期发作的进行性神经退行性病变。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
儿童期发作的进行性神经退行性病变 VAC14突变导致PIKfyve复合物功能异常,影响PI(3,5)P2合成,破坏内体/溶酶体稳态,导致神经元功能障碍和退行性变。 已明确致病
腓骨肌萎缩症 部分VAC14突变与腓骨肌萎缩症相关,但证据有限。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1540C>T (p.Arg514Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1622G>A (p.Arg541His) 错义突变 罕见 可能为Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

VAC14功能缺失突变导致PIKfyve复合物活性降低,PI(3,5)P2合成减少,影响内体/溶酶体功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005737 (cytoplasm) • GO:0005764 (lysosome)
• GO:0005768 (endosome) • GO:0032045 (PIKFYVE complex)
• GO:0046854 (phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process)

相关通路

PIKFYVE pathway (Reactome: R-HSA-1660499)
Phosphatidylinositol phosphate metabolism (KEGG: map00562)

蛋白质功能简介

VAC14蛋白是PIKfyve复合物的支架蛋白,与PIKfyve和FIG4相互作用,调控磷脂酰肌醇3,5-二磷酸的合成。该蛋白在内体/溶酶体途径中发挥关键作用,影响膜运输和细胞信号传导。VAC14突变可导致神经退行性疾病,其功能研究对理解相关疾病机制具有重要意义。

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