VPS13C基因|功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
VPS13C基因编码液泡蛋白分选相关蛋白,参与线粒体稳态和脂质代谢,其突变与帕金森病和神经退行性疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | VPS13C |
|---|---|
| 基因全名 | Vacuolar protein sorting 13 homolog C |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 15q21.2 |
| NCBI Gene ID | 10732 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10732 |
| Ensembl ID | ENSG00000129003 |
| UniProt ID | Q8NBS9 |
| OMIM ID | 608879 |
| HGNC ID | 14398 |
| 基因别名 | KIAA1054, FLJ10851, MGC126851 |
基因功能与研究简介
VPS13C基因编码液泡蛋白分选相关蛋白,属于VPS13家族,参与细胞内囊泡运输、线粒体稳态和脂质代谢。VPS13C蛋白定位于线粒体相关膜,调节线粒体功能。VPS13C基因突变与帕金森病和神经退行性疾病相关,尤其是早发性帕金森病。研究表明,VPS13C功能缺失导致线粒体功能障碍、氧化应激和细胞死亡,提示其在神经保护中的重要作用。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 帕金森病 | VPS13C突变导致蛋白功能缺失,影响线粒体稳态和脂质代谢,导致多巴胺能神经元死亡。 | 已明确致病 |
| 神经退行性疾病 | VPS13C突变与多种神经退行性疾病相关,包括阿尔茨海默病和肌萎缩侧索硬化症,但证据尚不充分。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.3344C>T (p.Arg1115Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.6010C>T (p.Arg2004Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1045C>T (p.Arg349Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
VPS13C功能缺失突变导致蛋白截短或降解,影响线粒体稳态和脂质代谢,导致细胞功能障碍。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005739 (mitochondrion) |
| • GO:0005783 (endoplasmic reticulum) | • GO:0005794 (Golgi apparatus) |
| • GO:0006886 (intracellular protein transport) | • GO:0007005 (mitochondrion organization) |
| • GO:0006644 (phospholipid metabolic process) |
相关通路
• Mitophagy (WP4239)
• Parkinson's disease pathway (WP481)
蛋白质功能简介
VPS13C蛋白是VPS13家族成员,定位于线粒体相关膜,参与线粒体分裂和融合的调控。它通过与多个蛋白相互作用,调节脂质转运和线粒体自噬。VPS13C功能缺失导致线粒体碎片化、呼吸链受损和氧化应激增加,最终导致细胞死亡。