VPS13C基因|功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

VPS13C基因编码液泡蛋白分选相关蛋白,参与线粒体稳态和脂质代谢,其突变与帕金森病和神经退行性疾病相关。

基因信息卡

基因符号 VPS13C
基因全名 Vacuolar protein sorting 13 homolog C
基因类型 protein-coding
染色体位置 15q21.2
NCBI Gene ID 10732 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10732
Ensembl ID ENSG00000129003
UniProt ID Q8NBS9
OMIM ID 608879
HGNC ID 14398
基因别名 KIAA1054, FLJ10851, MGC126851

基因功能与研究简介

VPS13C基因编码液泡蛋白分选相关蛋白,属于VPS13家族,参与细胞内囊泡运输、线粒体稳态和脂质代谢。VPS13C蛋白定位于线粒体相关膜,调节线粒体功能。VPS13C基因突变与帕金森病和神经退行性疾病相关,尤其是早发性帕金森病。研究表明,VPS13C功能缺失导致线粒体功能障碍、氧化应激和细胞死亡,提示其在神经保护中的重要作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
帕金森病 VPS13C突变导致蛋白功能缺失,影响线粒体稳态和脂质代谢,导致多巴胺能神经元死亡。 已明确致病
神经退行性疾病 VPS13C突变与多种神经退行性疾病相关,包括阿尔茨海默病和肌萎缩侧索硬化症,但证据尚不充分。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脑 暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 中等表达
骨骼肌 暂无可靠数据 中等表达
肝脏 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.3344C>T (p.Arg1115Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.6010C>T (p.Arg2004Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1045C>T (p.Arg349Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

VPS13C功能缺失突变导致蛋白截短或降解,影响线粒体稳态和脂质代谢,导致细胞功能障碍。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005739 (mitochondrion)
• GO:0005783 (endoplasmic reticulum) • GO:0005794 (Golgi apparatus)
• GO:0006886 (intracellular protein transport) • GO:0007005 (mitochondrion organization)
• GO:0006644 (phospholipid metabolic process)

相关通路

• Mitophagy (WP4239)
• Parkinson's disease pathway (WP481)

蛋白质功能简介

VPS13C蛋白是VPS13家族成员,定位于线粒体相关膜,参与线粒体分裂和融合的调控。它通过与多个蛋白相互作用,调节脂质转运和线粒体自噬。VPS13C功能缺失导致线粒体碎片化、呼吸链受损和氧化应激增加,最终导致细胞死亡。

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