VPS13C基因|功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

VPS13C基因编码液泡蛋白分选相关蛋白,参与线粒体稳态和脂质代谢,其突变与帕金森病和神经退行性疾病相关。

基因信息卡

基因符号 VPS13C
基因全名 Vacuolar protein sorting 13 homolog C
基因类型 protein-coding
染色体位置 15q21.2
NCBI Gene ID 10732 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10732
Ensembl ID ENSG00000129003
UniProt ID Q8NBS9
OMIM ID 608879
HGNC ID 14398
基因别名 KIAA1054, FLJ10851, MGC126851

基因功能与研究简介

VPS13C基因编码液泡蛋白分选相关蛋白,属于VPS13家族,参与细胞内囊泡运输、线粒体稳态和脂质代谢。VPS13C蛋白定位于线粒体相关膜,调节线粒体功能。VPS13C基因突变与帕金森病和神经退行性疾病相关,尤其是早发性帕金森病。研究表明,VPS13C功能缺失导致线粒体功能障碍、氧化应激和细胞死亡,提示其在神经保护中的重要作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
帕金森病 VPS13C突变导致蛋白功能缺失,影响线粒体稳态和脂质代谢,导致多巴胺能神经元死亡。 已明确致病
神经退行性疾病 VPS13C突变与多种神经退行性疾病相关,包括阿尔茨海默病和肌萎缩侧索硬化症,但证据尚不充分。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 中等表达
骨骼肌 暂无可靠数据 中等表达
肝脏 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.3344C>T (p.Arg1115Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.6010C>T (p.Arg2004Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1045C>T (p.Arg349Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

VPS13C功能缺失突变导致蛋白截短或降解,影响线粒体稳态和脂质代谢,导致细胞功能障碍。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005739 (mitochondrion)
• GO:0005783 (endoplasmic reticulum) • GO:0005794 (Golgi apparatus)
• GO:0006886 (intracellular protein transport) • GO:0007005 (mitochondrion organization)
• GO:0006644 (phospholipid metabolic process)

相关通路

Mitophagy (WP4239)
Parkinson's disease pathway (WP481)

蛋白质功能简介

VPS13C蛋白是VPS13家族成员,定位于线粒体相关膜,参与线粒体分裂和融合的调控。它通过与多个蛋白相互作用,调节脂质转运和线粒体自噬。VPS13C功能缺失导致线粒体碎片化、呼吸链受损和氧化应激增加,最终导致细胞死亡。

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