ZMYND11基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ZMYND11是一种表观遗传调控因子,参与转录延伸和RNA剪接,其突变与多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | ZMYND11 |
|---|---|
| 基因全名 | zinc finger MYND-type containing 11 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 10p15.3 |
| NCBI Gene ID | 10771 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10771 |
| Ensembl ID | ENSG00000119922 |
| UniProt ID | Q96T55 |
| OMIM ID | 608668 |
| HGNC ID | 13057 |
| 基因别名 | BRD1, BS69 |
基因功能与研究简介
ZMYND11(zinc finger MYND-type containing 11)基因编码一种含有MYND型锌指结构域的蛋白质,该蛋白作为表观遗传调控因子,参与转录延伸和RNA剪接的调控。ZMYND11通过识别组蛋白H3.3的K36me3修饰,抑制转录延伸,并参与mRNA前体的剪接调控。研究表明,ZMYND11在多种癌症中表达异常,其突变或表达下调与肿瘤的发生发展密切相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | ZMYND11表达下调与乳腺癌的侵袭性和不良预后相关,可能通过影响转录调控和剪接促进肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | ZMYND11在肺癌中表达降低,可能参与肿瘤抑制,其缺失促进细胞增殖和迁移。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | ZMYND11突变或表达异常与结直肠癌的发生相关,可能通过影响Wnt信号通路。 | 潜在关联 |
| 胶质瘤 | ZMYND11表达水平与胶质瘤分级相关,可能作为预后标志物。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.567_568del (p.Glu190fs) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.789A>G (p.Ile263Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变,导致ZMYND11蛋白功能丧失或减弱,可能通过影响转录调控和剪接促进肿瘤发生。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明ZMYND11存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明ZMYND11存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0006355 regulation of transcription | • DNA-templated |
| • GO:0006397 mRNA processing | • GO:0008380 RNA splicing |
| • GO:0042800 histone methyltransferase activity (H3-K36 specific) |
相关通路
• hsa03040 Spliceosome
• hsa05034 Alcoholism (related to histone modification)
蛋白质功能简介
ZMYND11蛋白含有MYND型锌指结构域,能够识别组蛋白H3.3的K36me3修饰,从而抑制转录延伸。此外,ZMYND11还参与RNA剪接的调控,通过与剪接因子相互作用影响mRNA前体的加工。该蛋白在多种组织中表达,在肿瘤中常表现为表达下调或突变,提示其可能作为肿瘤抑制因子。