ZMYND11基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

ZMYND11是一种表观遗传调控因子,参与转录延伸和RNA剪接,其突变与多种癌症相关。

基因信息卡

基因符号 ZMYND11
基因全名 zinc finger MYND-type containing 11
基因类型 protein-coding
染色体位置 10p15.3
NCBI Gene ID 10771 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10771
Ensembl ID ENSG00000119922
UniProt ID Q96T55
OMIM ID 608668
HGNC ID 13057
基因别名 BRD1, BS69

基因功能与研究简介

ZMYND11(zinc finger MYND-type containing 11)基因编码一种含有MYND型锌指结构域的蛋白质,该蛋白作为表观遗传调控因子,参与转录延伸和RNA剪接的调控。ZMYND11通过识别组蛋白H3.3的K36me3修饰,抑制转录延伸,并参与mRNA前体的剪接调控。研究表明,ZMYND11在多种癌症中表达异常,其突变或表达下调与肿瘤的发生发展密切相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
乳腺癌 ZMYND11表达下调与乳腺癌的侵袭性和不良预后相关,可能通过影响转录调控和剪接促进肿瘤进展。 较强研究证据
肺癌 ZMYND11在肺癌中表达降低,可能参与肿瘤抑制,其缺失促进细胞增殖和迁移。 较强研究证据
结直肠癌 ZMYND11突变或表达异常与结直肠癌的发生相关,可能通过影响Wnt信号通路。 潜在关联
胶质瘤 ZMYND11表达水平与胶质瘤分级相关,可能作为预后标志物。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脑 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.567_568del (p.Glu190fs) 移码突变 罕见 Loss of Function
c.789A>G (p.Ile263Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变,导致ZMYND11蛋白功能丧失或减弱,可能通过影响转录调控和剪接促进肿瘤发生。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明ZMYND11存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明ZMYND11存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005634 nucleus
• GO:0006355 regulation of transcription • DNA-templated
• GO:0006397 mRNA processing • GO:0008380 RNA splicing
• GO:0042800 histone methyltransferase activity (H3-K36 specific)

相关通路

• hsa03040 Spliceosome
• hsa05034 Alcoholism (related to histone modification)

蛋白质功能简介

ZMYND11蛋白含有MYND型锌指结构域,能够识别组蛋白H3.3的K36me3修饰,从而抑制转录延伸。此外,ZMYND11还参与RNA剪接的调控,通过与剪接因子相互作用影响mRNA前体的加工。该蛋白在多种组织中表达,在肿瘤中常表现为表达下调或突变,提示其可能作为肿瘤抑制因子。

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