ABCB11基因|胆汁酸盐输出泵功能、进行性家族性肝内胆汁淤积症2型(PFIC2)与突变研究
ABCB11编码胆汁酸盐输出泵(BSEP),其突变导致进行性家族性肝内胆汁淤积症2型(PFIC2),是胆汁淤积性肝病的重要致病基因。
基因信息卡
| 基因符号 | ABCB11 |
|---|---|
| 基因全名 | ATP Binding Cassette Subfamily B Member 11 |
| 基因类型 | 蛋白编码基因 |
| 染色体位置 | 2q31.1 |
| NCBI Gene ID | 8647 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8647 |
| Ensembl ID | ENSG00000073734 |
| UniProt ID | O95342 |
| OMIM ID | 603201 |
| HGNC ID | 42 |
| 基因别名 | BSEP, PFIC2, ABC16, SPGP |
基因功能与研究简介
ABCB11基因编码胆汁酸盐输出泵(Bile Salt Export Pump, BSEP),属于ATP结合盒(ABC)转运蛋白超家族。BSEP主要表达于肝细胞毛细胆管膜,负责将胆汁酸盐从肝细胞转运至胆汁,是胆汁形成的关键步骤。ABCB11基因突变可导致进行性家族性肝内胆汁淤积症2型(PFIC2),表现为严重的胆汁淤积、肝内胆汁酸盐蓄积,进而导致肝损伤和肝硬化。此外,ABCB11多态性也可能与药物性肝损伤和妊娠期肝内胆汁淤积症相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 进行性家族性肝内胆汁淤积症2型(PFIC2) | ABCB11基因突变导致BSEP功能缺失或降低,胆汁酸盐无法正常分泌至胆小管,在肝细胞内蓄积,引起肝细胞损伤和胆汁淤积。 | 已明确致病(OMIM 601847) |
| 良性复发性肝内胆汁淤积症2型(BRIC2) | 部分ABCB11突变导致BSEP功能部分降低,引起间歇性胆汁淤积,但通常不进展为肝衰竭。 | 已明确致病(OMIM 605479) |
| 药物性肝损伤(DILI) | ABCB11基因多态性可能影响BSEP功能,增加药物性肝损伤的风险。 | 具有较强研究证据(ClinVar) |
| 妊娠期肝内胆汁淤积症(ICP) | ABCB11基因变异可能增加ICP的易感性,但具体机制尚不完全清楚。 | 潜在关联(研究证据) |
| 肝细胞癌(HCC) | ABCB11表达下调或突变可能参与肝细胞癌的发生发展,但证据尚不充分。 | 潜在关联(研究证据) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 高表达(BSEP主要表达于肝细胞毛细胆管膜) |
| 其他组织 | 暂无可靠数据 | 低表达或检测不到 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系,内源性表达ABCB11 |
| Huh7 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系,内源性表达ABCB11 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用异源表达系统,需转染ABCB11质粒 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1445A>G (p.Asp482Gly) | 错义突变 | 罕见 | 功能影响:降低BSEP表达和转运活性,导致PFIC2 |
| c.890A>G (p.Glu297Gly) | 错义突变 | 罕见 | 功能影响:影响BSEP蛋白折叠和定位,导致PFIC2 |
| c.3457C>T (p.Arg1153Cys) | 错义突变 | 罕见 | 功能影响:降低BSEP转运功能,与BRIC2相关 |
| c.1331T>C (p.Val444Ala) | 单核苷酸多态性 | 常见(等位基因频率约0.5) | 功能影响:可能影响BSEP表达和功能,与DILI和ICP风险相关 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
大多数ABCB11致病突变导致BSEP功能丧失或显著降低,包括无义突变、移码突变、剪接位点突变和错义突变,导致胆汁酸盐转运障碍。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明ABCB11存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
部分错义突变可能通过显性负效应干扰野生型BSEP的功能,但证据有限。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005524 (ATP binding) | • GO:0015421 (ABC-type xenobiotic transporter activity) |
| • GO:0015125 (bile acid transmembrane transporter activity) | • GO:0016324 (apical plasma membrane) |
| • GO:0005886 (plasma membrane) | • GO:0016021 (integral component of membrane) |
| • GO:0006810 (transport) | • GO:0015722 (bile acid transport) |
相关通路
• Bile secretion (KEGG: hsa04976)
• ABC transporters (KEGG: hsa02010)
蛋白质功能简介
ABCB11编码的BSEP蛋白由1321个氨基酸组成,属于ABC转运蛋白家族。BSEP包含两个跨膜结构域(TMD)和两个核苷酸结合结构域(NBD),通过水解ATP提供能量,将胆汁酸盐从肝细胞转运至胆小管。BSEP主要表达于肝细胞毛细胆管膜,对维持胆汁酸稳态至关重要。BSEP功能缺陷导致胆汁酸盐在肝细胞内蓄积,引发胆汁淤积性肝病。