ABI3BP基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ABI3BP编码一种细胞外基质蛋白,参与细胞粘附、增殖和衰老调控,与多种癌症及纤维化疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | ABI3BP |
|---|---|
| 基因全名 | ABI family member 3 binding protein |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 3q12.2 |
| NCBI Gene ID | 25890 ncbi.nlm.nih.gov/gene/25890 |
| Ensembl ID | ENSG00000114544 |
| UniProt ID | Q9H7J4 |
| OMIM ID | 609360 |
| HGNC ID | 24017 |
| 基因别名 | TARSH, NESHBP |
基因功能与研究简介
ABI3BP(ABI family member 3 binding protein)基因编码一种细胞外基质蛋白,属于ABI家族成员3的结合蛋白。该蛋白在多种组织中表达,参与细胞粘附、增殖、迁移和衰老等过程。研究表明,ABI3BP在多种肿瘤中表达下调,可能作为肿瘤抑制因子发挥作用。此外,ABI3BP还参与肺纤维化等疾病的病理过程。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肺癌 | ABI3BP在肺癌组织中表达下调,可能通过调控细胞增殖和凋亡参与肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | ABI3BP在乳腺癌中表达降低,与肿瘤侵袭和转移相关。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | ABI3BP表达下调与结直肠癌的进展和不良预后相关。 | 较强研究证据 |
| 肺纤维化 | ABI3BP在肺纤维化组织中表达上调,可能参与纤维化过程。 | 较强研究证据 |
| 衰老相关疾病 | ABI3BP参与细胞衰老调控,可能影响衰老相关疾病的发生。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.567delA (p.Lys189fs) | 移码突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.890A>G (p.Gln297Arg) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能,但具体影响未知 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,如无义突变或移码突变,导致蛋白截短或降解,使ABI3BP功能缺失,可能促进肿瘤发生。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明ABI3BP存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明ABI3BP存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0007155 (cell adhesion) | • GO:0008283 (cell population proliferation) |
| • GO:0007568 (aging) | • GO:0005576 (extracellular region) |
| • GO:0005615 (extracellular space) |
相关通路
• 暂无明确Pathway ID,但可能参与ECM-receptor interaction和PI3K-Akt signaling pathway。
蛋白质功能简介
ABI3BP蛋白是一种分泌性细胞外基质蛋白,含有多个功能域,包括EGF样结构域和纤连蛋白III型结构域。该蛋白在细胞外基质中发挥作用,调节细胞与基质之间的相互作用,影响细胞粘附、迁移和增殖。ABI3BP在多种正常组织中表达,但在多种肿瘤中表达下调,提示其可能作为肿瘤抑制因子。此外,ABI3BP还参与细胞衰老和纤维化过程。