CADM4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
CADM4(细胞黏附分子4)在细胞黏附、肿瘤抑制及神经系统中发挥重要作用,其突变与多种癌症及神经系统疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | CADM4 |
|---|---|
| 基因全名 | cell adhesion molecule 4 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 19q13.32 |
| NCBI Gene ID | 199731 ncbi.nlm.nih.gov/gene/199731 |
| Ensembl ID | ENSG00000105699 |
| UniProt ID | Q8NFZ8 |
| OMIM ID | 609904 |
| HGNC ID | 30878 |
| 基因别名 | TSLL2, NECL4, IGSF4C, SynCAM4 |
基因功能与研究简介
CADM4(细胞黏附分子4)属于免疫球蛋白超家族,编码一种I型膜蛋白,参与细胞间黏附、细胞极性及信号转导。在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。研究表明CADM4在多种肿瘤中表达下调,发挥肿瘤抑制作用。此外,CADM4参与神经突触的形成和维持,与神经系统功能密切相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | CADM4表达下调与肝细胞癌的进展和不良预后相关,可能通过影响细胞黏附促进肿瘤侵袭和转移。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | CADM4在乳腺癌中表达降低,可能通过调节细胞凋亡和增殖参与肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | CADM4表达缺失与结直肠癌的恶性程度相关,可能作为抑癌基因发挥作用。 | 较强研究证据 |
| 精神分裂症 | CADM4基因变异与精神分裂症风险相关,可能通过影响突触功能参与疾病发生。 | 潜在关联 |
| 自闭症谱系障碍 | CADM4在神经发育中的作用提示其可能与自闭症相关,但证据尚不充分。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 表达下调 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 表达下调 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123C>T (p.Arg41Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.456G>A (p.Trp152Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.789delC (p.Leu264TrpfsTer5) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1024A>G (p.Thr342Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变,导致CADM4蛋白表达减少或功能丧失,可能促进肿瘤发生。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明CADM4存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明CADM4存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0007155 (cell adhesion) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0007156 (homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules) | • GO:0045202 (synapse) |
| • GO:0005515 (protein binding) |
相关通路
• Cell adhesion molecules (CAMs) - Homo sapiens (human) (hsa04514)
• Adherens junction - Homo sapiens (human) (hsa04520)
蛋白质功能简介
CADM4蛋白是一种I型膜蛋白,属于免疫球蛋白超家族,包含三个免疫球蛋白样C2型结构域和一个胞内PDZ结合基序。它介导同嗜性细胞黏附,参与细胞极性、突触形成和信号转导。在肿瘤中,CADM4表达下调导致细胞黏附减弱,促进肿瘤侵袭和转移。在神经系统中,CADM4参与突触的成熟和功能维持。