GSDMD基因|基因功能、疾病关联、突变与细胞焦亡研究
GSDMD是细胞焦亡的关键执行者,其裂解和膜打孔功能在炎症和免疫中发挥核心作用。
基因信息卡
| 基因符号 | GSDMD |
|---|---|
| 基因全名 | Gasdermin D |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 8q24.3 |
| NCBI Gene ID | 79792 ncbi.nlm.nih.gov/gene/79792 |
| Ensembl ID | ENSG00000104518 |
| UniProt ID | P57764 |
| OMIM ID | 617042 |
| HGNC ID | 25697 |
| 基因别名 | DFNA5L, FKSG10, GSDMDC1, GSDMDCT |
基因功能与研究简介
GSDMD基因编码gasdermin D蛋白,是细胞焦亡(pyroptosis)的关键执行者。在炎症小体激活后,caspase-1或caspase-11/4/5切割GSDMD,释放N端结构域,其在细胞膜上形成孔洞,导致细胞裂解和促炎因子释放。GSDMD在固有免疫、炎症反应和多种疾病中发挥重要作用。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 炎症性肠病 | GSDMD介导的细胞焦亡参与肠道炎症调控,其异常可能加重炎症反应。 | 较强研究证据 |
| 败血症 | GSDMD介导的细胞焦亡在败血症中促进炎症因子释放,加重组织损伤。 | 较强研究证据 |
| 家族性寒冷型自身炎症综合征 | GSDMD作为gasdermin家族成员,其突变可能影响细胞焦亡,但直接致病证据不足。 | 潜在关联 |
| 癌症 | GSDMD在多种肿瘤中表达异常,可能通过调节炎症和免疫影响肿瘤进展。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 胃 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 小肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 免疫细胞 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| THP-1 | 暂无可靠数据 | 单核细胞系 |
| U937 | 暂无可靠数据 | 单核细胞系 |
| RAW264.7 | 暂无可靠数据 | 小鼠巨噬细胞系 |
| BMDM | 暂无可靠数据 | 骨髓来源巨噬细胞 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.484C>T (p.Arg162*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致截短蛋白,可能影响细胞焦亡功能。 |
| c.706C>T (p.Arg236Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或功能,但具体影响需进一步研究。 |
| c.1183C>T (p.Arg395*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,可能影响C端结构域,导致功能缺失。 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变,如无义突变导致截短蛋白,可能降低或消除GSDMD的膜打孔活性,从而抑制细胞焦亡。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变,如某些错义突变可能增强GSDMD的切割或膜打孔能力,导致过度炎症。目前尚无明确报道。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变,突变蛋白可能干扰野生型GSDMD的功能,但尚无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0016020 membrane | • GO:0005737 cytoplasm |
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0019835 cytolysis |
| • GO:0006954 inflammatory response | • GO:0070268 pyroptosis |
相关通路
• hsa04621 NOD-like receptor signaling pathway
• hsa04668 TNF signaling pathway
• hsa05131 Shigellosis
• hsa05134 Legionellosis
• hsa05135 Salmonella infection
蛋白质功能简介
GSDMD蛋白属于gasdermin家族,包含N端成孔结构域和C端抑制结构域。在静息状态下,C端结构域抑制N端活性。当炎症小体激活时,caspase-1或caspase-11/4/5在Asp275位点切割GSDMD,释放N端结构域,其寡聚化并在细胞膜上形成孔洞,导致细胞渗透性裂解和促炎因子释放。GSDMD在固有免疫中发挥关键作用,其异常与多种炎症性疾病相关。