TNFRSF1A基因|基因功能、疾病关联、突变与信号通路研究
TNFRSF1A编码肿瘤坏死因子受体1,是调控炎症、细胞凋亡与免疫应答的关键分子,其突变与自身炎症性疾病及肿瘤发生密切相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TNFRSF1A |
|---|---|
| 基因全名 | TNF receptor superfamily member 1A |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 12p13.31 |
| NCBI Gene ID | 7132 ncbi.nlm.nih.gov/gene/7132 |
| Ensembl ID | ENSG00000067182 |
| UniProt ID | P19438 |
| OMIM ID | 191190 |
| HGNC ID | 11916 |
| 基因别名 | TNFR1, TNF-R, TNFAR, TNFR60, p55, p55-R, TNFRSF1A |
基因功能与研究简介
TNFRSF1A基因编码肿瘤坏死因子受体1(TNFR1),属于肿瘤坏死因子受体超家族。该受体广泛表达于多种细胞表面,主要结合肿瘤坏死因子-α(TNF-α),激活下游NF-κB、MAPK和凋亡信号通路,参与炎症反应、免疫调节、细胞增殖与凋亡等过程。TNFR1的异常与多种自身免疫性疾病、炎症性疾病及肿瘤相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肿瘤坏死因子受体相关周期性综合征(TRAPS) | TNFRSF1A基因突变导致TNFR1结构异常,影响受体脱落和信号转导,引起周期性发热和炎症。 | 已明确致病(OMIM) |
| 多发性硬化(MS) | TNFRSF1A基因多态性(如rs1800693)与MS风险相关,可能影响TNFR1的剪接和功能。 | 较强研究证据(GWAS) |
| 类风湿关节炎(RA) | TNFRSF1A基因变异与RA易感性相关,TNFR1介导的TNF信号在RA发病中起重要作用。 | 较强研究证据(关联研究) |
| 炎症性肠病(IBD) | TNFRSF1A基因多态性与IBD风险相关,TNFR1信号参与肠道炎症调控。 | 潜在关联(关联研究) |
| 癌症 | TNFRSF1A在多种肿瘤中表达异常,可能通过调节炎症和凋亡影响肿瘤发生发展。 | 潜在关联(研究证据) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 血液 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| Jurkat | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| THP-1 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.362G>A (p.Arg121Gln) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响受体结构,与TRAPS相关 |
| c.255T>G (p.Cys85Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响二硫键形成,与TRAPS相关 |
| c.473G>A (p.Arg158His) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响受体功能,与TRAPS相关 |
| rs1800693 (c.625A>G) | 剪接位点多态性 | 常见 | 可能影响TNFR1剪接,与MS风险相关 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变:导致TNFR1蛋白表达减少或功能丧失,可能影响TNF信号传导,与免疫缺陷或炎症调控异常相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变:增强TNFR1信号传导,可能导致过度炎症反应,与自身炎症性疾病相关。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变:突变蛋白干扰正常TNFR1功能,可能影响受体复合物形成,与TRAPS等疾病相关。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005031 (tumor necrosis factor-activated receptor activity) | • GO:0004871 (signal transducer activity) |
| • GO:0007165 (signal transduction) | • GO:0006915 (apoptotic process) |
| • GO:0006954 (inflammatory response) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
相关通路
• TNF signaling pathway (KEGG: hsa04668)
• Apoptosis (KEGG: hsa04210)
• NF-kappa B signaling pathway (KEGG: hsa04064)
• Cytokine-cytokine receptor interaction (KEGG: hsa04060)
蛋白质功能简介
TNFRSF1A编码的TNFR1蛋白是I型跨膜受体,由455个氨基酸组成,包含胞外富含半胱氨酸的结构域、跨膜区和胞内死亡结构域。TNFR1与TNF-α结合后,招募TRADD、TRAF2和RIPK1等接头蛋白,激活NF-κB和MAPK通路,或诱导细胞凋亡。TNFR1在免疫细胞、上皮细胞等多种细胞中表达,参与炎症、免疫应答和细胞命运决定。