TSPAN18基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
TSPAN18(四旋蛋白18)是四旋蛋白家族成员,参与细胞黏附、迁移和信号转导,与精神分裂症和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TSPAN18 |
|---|---|
| 基因全名 | tetraspanin 18 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 11q12.2 |
| NCBI Gene ID | 340348 ncbi.nlm.nih.gov/gene/340348 |
| Ensembl ID | ENSG00000165949 |
| UniProt ID | Q5J5R4 |
| OMIM ID | 615143 |
| HGNC ID | 28298 |
| 基因别名 | TSPAN18 |
基因功能与研究简介
TSPAN18(tetraspanin 18)是四旋蛋白家族的成员,该家族蛋白以四个跨膜结构域为特征,参与细胞黏附、迁移、增殖和信号转导。TSPAN18在多种组织中表达,尤其在脑和胎盘中水平较高。研究表明,TSPAN18可能通过调节细胞表面受体和整合素的功能,影响细胞与微环境的相互作用。此外,TSPAN18基因变异与精神分裂症风险相关,并在多种癌症中异常表达,提示其在肿瘤发生发展中可能发挥作用。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 精神分裂症 | TSPAN18基因变异可能影响神经发育和突触功能,增加精神分裂症风险。 | GWAS研究显示TSPAN18位点与精神分裂症显著关联(PMID: 25056061) |
| 肝细胞癌 | TSPAN18在肝细胞癌中表达下调,可能通过影响细胞黏附和迁移参与肿瘤抑制。 | 免疫组化显示TSPAN18表达降低与肿瘤分期和预后不良相关(PMID: 29295995) |
| 乳腺癌 | TSPAN18在乳腺癌中表达上调,可能促进肿瘤细胞迁移和侵袭。 | 体外实验显示TSPAN18过表达增强乳腺癌细胞迁移能力(PMID: 29326435) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达(GTEx) |
| 胎盘 | 暂无可靠数据 | 高表达(GTEx) |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达(GTEx) |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 低表达(GTEx) |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| rs11191580 | SNV | 0.3 | 位于内含子,可能影响剪接或调控,与精神分裂症关联(PMID: 25056061) |
| c.500C>T (p.Pro167Leu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能影响未知(ClinVar) |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
TSPAN18功能缺失可能影响细胞黏附,但具体证据不足。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0007155 (cell adhesion) |
相关通路
• 暂无明确通路数据
蛋白质功能简介
TSPAN18蛋白属于四旋蛋白家族,具有四个跨膜结构域和两个胞外环。它定位于细胞膜,可能参与细胞黏附、迁移和信号转导。TSPAN18通过与整合素和其他膜蛋白相互作用,调节细胞与细胞外基质的相互作用。在脑组织中,TSPAN18可能影响神经突触的形成和可塑性。