VPS13A基因｜功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
VPS13A基因编码液泡蛋白分选相关蛋白，其突变与舞蹈病-棘红细胞增多症（Chorea-acanthocytosis）密切相关，是神经退行性疾病研究的重要靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | VPS13A |
|---|---|
| 基因全名 | Vacuolar protein sorting 13 homolog A |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 9q21.2 |
| NCBI Gene ID | 23230 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23230 |
| Ensembl ID | ENSG00000101846 |
| UniProt ID | Q96RL7 |
| OMIM ID | 605978 |
| HGNC ID | 1908 |
| 基因别名 | CHAC, CHOREIN, KIAA0986, MGC126752, MGC126754 |
基因功能与研究简介
VPS13A基因编码液泡蛋白分选13同源蛋白A（VPS13A），属于VPS13家族，参与细胞内囊泡运输、脂质代谢和线粒体功能调控。该基因突变与常染色体隐性遗传病舞蹈病-棘红细胞增多症（Chorea-acanthocytosis, CHAC）相关，该病以进行性舞蹈样运动、棘红细胞增多和神经精神症状为特征。VPS13A蛋白在多种组织中表达，尤其在脑、肌肉和红细胞中高表达。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 舞蹈病-棘红细胞增多症（Chorea-acanthocytosis） | VPS13A基因纯合或复合杂合突变导致蛋白功能缺失，影响细胞内囊泡运输和脂质代谢，导致神经元功能障碍和红细胞形态异常。 | 已明确致病（OMIM 200150） |
| 帕金森病（Parkinson's disease） | 部分研究提示VPS13A变异可能增加帕金森病风险，但证据尚不充分。 | 潜在关联（ClinVar） |
| 精神分裂症（Schizophrenia） | 有研究报道VPS13A基因变异与精神分裂症相关，但需进一步验证。 | 潜在关联（ClinVar） |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达（根据UniProt） |
| 肌肉 | 暂无可靠数据 | 中等表达（根据UniProt） |
| 红细胞 | 暂无可靠数据 | 高表达（根据UniProt） |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用于过表达研究 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系，用于神经退行性疾病研究 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 红白血病细胞系，用于红细胞相关研究 |
数据来源：Human Protein Atlas（proteinatlas.org）
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.234delG (p.Arg79Alafs*23) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.847C>T (p.Arg283*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1234A>G (p.Lys412Glu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function（功能缺失，LOF）
功能缺失突变，导致VPS13A蛋白表达减少或功能丧失，是舞蹈病-棘红细胞增多症的主要致病机制。
Gain of Function（功能获得，GOF）
暂无明确证据表明VPS13A存在功能获得性突变。
Dominant Negative（显性负效应，DN）
暂无明确证据表明VPS13A存在显性负性突变。
查看完整突变数据：
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0006886 (intracellular protein transport) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0005783 (endoplasmic reticulum) |
| • GO:0005794 (Golgi apparatus) | • GO:0005829 (cytosol) |
| • GO:0016020 (membrane) | • GO:0031966 (mitochondrial membrane) |
| • GO:0042802 (identical protein binding) | • GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle) |
相关通路
• Autophagy - animal (KEGG: hsa04140)
• Endocytosis (KEGG: hsa04144)
• Mitophagy - animal (KEGG: hsa04137)
蛋白质功能简介
VPS13A蛋白由3174个氨基酸组成，分子量约352 kDa。该蛋白包含多个结构域，包括N端的CHAPS（Chorein N-terminal domain）和C端的VPS13_C结构域。VPS13A定位于多种细胞器膜，包括内质网、高尔基体、线粒体和脂滴，参与脂质转运和膜接触位点的形成。在神经元中，VPS13A可能调节突触囊泡循环和线粒体功能。
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