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基因敲除细胞库 - pri-miRNA转录正调控
miRNA 是一类广泛参与基因转录后调控的小非编码 RNA,其初级转录本(pri-miRNA)由 RNA 聚合酶 II(Pol II)催化合成。pri-miRNA 的转录受到多种转录因子、共激活因子和信号通路的精密调控,其异常与肿瘤、心血管疾病、发育缺陷及代谢性疾病密切相关。针对该通路关键调控因子的基因敲除细胞系,可用于解析 miRNA 表达的转录调控网络、鉴定组织特异性 miRNA 的调控元件,并支持相关疾病的药物靶点发现。艾迪基因已构建覆盖该通路的 KO 细胞现货库,涵盖SRF、MYC、FOS、JUN、STAT3、TP53、SMAD3/4、HIF1A、PPARG、AR、EGFR等 60 余种基因敲除细胞模型,助力非编码 RNA 与转录调控研究。
pri-miRNA 的转录由 RNA 聚合酶 II 主导,其启动子区域通常包含多种转录因子结合位点,正调控因子通过响应胞外信号(生长因子、细胞因子、激素、低氧、TGF-β/BMP、Wnt/Notch 等)或直接与 Pol II 复合物互作来激活特定 miRNA 簇的转录。该通路的核心正调控因子包括:
· 血清反应因子(SRF)及其共激活因子
SRF 与 MRTFA、MRTFB、MYOCD 形成复合物,调控平滑肌和心肌富集的 miRNA(如 miR-1、miR-133、miR-145)。
· SMAD 转录因子
SMAD1、SMAD3、SMAD4 介导 TGF-β/BMP 信号(上游 BMP2、BMPR1A、TGFB1/2),诱导纤维化及上皮-间充质转化相关 miRNA;SMAD6 作为反馈调节因子。
· STAT3 与炎症相关转录因子
STAT3 响应 IL6、IL10 等,与 RELA(NF-κB 亚基)、FOS/JUN(AP-1)、FOSL1 协同调控免疫炎症相关 miRNA。
· 肿瘤相关转录因子
TP53 激活 miR-34 家族;MYC、MYCN 广泛促进 miRNA 簇(如 miR-17~92)转录;ETS1 参与血管生成相关 miRNA;WT1 调控肾脏发育相关 miRNA。
· 低氧与代谢调控因子
HIF1A 在低氧下诱导 miR-210 等;PPARG 调控脂肪分化相关 miRNA(如 miR-143);SREBF1/2 调节脂代谢相关 miRNA;NR1H2(LXRβ)参与胆固醇稳态。
· 激素信号相关因子
AR 响应雄激素,通过 FOXA1、GATA2、GATA3 等辅助因子调控前列腺特异性 miRNA;PRL(催乳素)和 NGFR 参与神经内分泌相关 miRNA;NR3C1(糖皮质激素受体)调控应激相关 miRNA。
· 发育与干细胞因子
PAX6、POU2F1(Oct1)、NOTCH2、NOTCH3、KLF4、EGR1、ATOH8 等调控胚胎发育、神经发生和干细胞维持中 miRNA 的表达。
· 染色质重塑与端粒
SMARCA4(BRG1)通过重塑染色质促进 Pol II 招募;TERT 和 GNL3 参与核仁结构与 miRNA 转录偶联。
· 自分泌/旁分泌信号分子
FGF2、PDGFB、EGFR、TNF、APLN、AGT 等通过相应受体激活下游转录因子,间接促进 pri-miRNA 转录。
· RNA 代谢相关调控因子
GTPBP2、HBS1L、CSDE1、PELO、CNOT6、TESK1 虽然主要参与 RNA 代谢,但可通过影响转录延伸或转录-降解耦合机制正调控 pri-miRNA 水平。
上述基因功能缺失将导致特定 miRNA 簇表达下降,进而影响细胞增殖、分化、凋亡及免疫应答,与多种疾病(如癌症、心肌肥厚、肺纤维化、糖尿病肾病)的发生发展密切相关。
The microRNA biogenesis pathway and its use in RNAi technology
(Kim et al., Nat Rev Mol Cell Biol, 2016)
pri-miRNA 转录正调控异常可导致以下疾病:多种癌症(如肝癌、乳腺癌、前列腺癌)、心肌肥厚和心力衰竭、肺动脉高压、肺纤维化、肾纤维化、糖尿病血管并发症、银屑病、神经系统发育异常及脂代谢紊乱。基因敲除细胞模型为解析不同转录因子对特定 pri-miRNA 的调控作用、揭示细胞信号如何通过转录因子网络影响 miRNA 谱系提供了理想工具,可支持机制研究、靶点验证和药物发现。
关键应用
· 肿瘤发生与转移模型
研究 TP53、MYC、FOS、JUN、STAT3、ETS1、WT1 等敲除对癌基因或抑癌 miRNA(如 miR-34、miR-21、miR-155)表达的影响,评估靶向转录因子的小分子抑制剂(如 STAT3 抑制剂、MYC 抑制剂)对 miRNA 网络的重编程作用。
· 心血管与纤维化疾病模型
研究 SRF、MRTF、MYOCD、SMAD3、SMAD4、TGFB1、NOTCH3 等敲除对心脏或平滑肌富集 miRNA(如 miR-1、miR-133、miR-145)及纤维化相关 miRNA 的调控,筛选抗心肌肥厚或抗纤维化药物。
· 代谢疾病与激素相关模型
研究 PPARG、SREBF1/2、HIF1A、AR、FOXA1、GATA2/3、NR1H2 等敲除对脂肪分化、胆固醇代谢及激素响应性 miRNA 的影响,探索代谢综合征和内分泌相关肿瘤的治疗靶点。
· 发育与干细胞模型
研究 PAX6、NOTCH2、KLF4、EGR1、POU2F1、ATOH8 等敲除对胚胎干细胞或神经前体细胞中 miRNA 转录调控的作用,解析发育相关 miRNA 的转录调控网络。
· RNA 代谢协同调控模型
研究 GTPBP2、HBS1L、CSDE1、PELO、CNOT6、TESK1 等敲除是否通过影响转录延伸或 RNA 稳定性间接改变 pri-miRNA 水平,揭示转录与 RNA 降解之间的耦合机制。
艾迪基因的pri-miRNA 转录正调控(RNA Pol II)敲除细胞系库包含已验证的、覆盖该通路 60 余种关键调控因子的现货细胞模型,可用于研究 miRNA 转录调控、信号转导与 miRNA 网络、疾病相关转录因子功能等。同时,我们提供现货和定制的基因敲除细胞系,以满足各种肿瘤、心血管、发育及代谢性疾病研究需求。更多靶点及细胞类型(HEK293、A549、HepG2、H9c2、RAW264.7 等)欢迎咨询。
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货号: EDC00205
物种: 人
细胞名称: hTERT-RPE1
基因名称: TP53
基因ID: 7157
规格: 1×10⁶cells
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货号: EDJ-KQ17770
物种: 人
细胞名称: HEK293
基因名称: TGFB1
基因ID: 7040
规格: 1×10⁶cells
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货号: EDJ-KQ17771
物种: 人
细胞名称: HEK293
基因名称: TGFB2
基因ID: 7042
规格: 1×10⁶cells
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货号: EDJ-KQ15359
物种: 人
细胞名称: HEK293
基因名称: SMARCA4
基因ID: 6597
规格: 1×10⁶cells
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